RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.19■■□□□ 1.78
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SGMS1-210ENST00000619438 SIL1Q9H173 461 aa26.18■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 CD209Q9NNX6 404 aa26.18■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 SRGAP3O43295 1099 aa26.17■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
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SGMS1-210ENST00000619438 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
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SGMS1-210ENST00000619438 PDE8BO95263 885 aa26.16■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 CNTROBQ8N137 903 aa26.16■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.16■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.16■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 SHTN1A0MZ66 631 aa26.15■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.15■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 SSH3Q8TE77 659 aa26.15■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.15■■□□□ 1.78
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SGMS1-210ENST00000619438 A0A1B0GUL6 1792 aa26.14■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 VPS37DQ86XT2 251 aa26.14■■□□□ 1.78
SGMS1-210ENST00000619438 FBXO3Q9UK99 471 aa26.14■■□□□ 1.78
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SGMS1-210ENST00000619438 USP17L8P0C7I0 530 aa26.12■■□□□ 1.77
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SGMS1-210ENST00000619438 POLA2Q14181 598 aa26.12■■□□□ 1.77
SGMS1-210ENST00000619438 DACT2Q5SW24 774 aa26.12■■□□□ 1.77
SGMS1-210ENST00000619438 TRPM4Q8TD43 1214 aa26.12■■□□□ 1.77
SGMS1-210ENST00000619438 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.12■■□□□ 1.77
SGMS1-210ENST00000619438 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.12■■□□□ 1.77
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SGMS1-210ENST00000619438 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.12■■□□□ 1.77
SGMS1-210ENST00000619438 OGFOD1Q8N543 542 aa26.12■■□□□ 1.77
SGMS1-210ENST00000619438 KIF2CQ99661 725 aa26.12■■□□□ 1.77
SGMS1-210ENST00000619438 MXD3Q9BW11 206 aa26.12■■□□□ 1.77
SGMS1-210ENST00000619438 COPRSQ9NQ92 184 aa26.12■■□□□ 1.77
SGMS1-210ENST00000619438 PSME4Q14997 1843 aa26.12■■□□□ 1.77
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SGMS1-210ENST00000619438 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.11■■□□□ 1.77
SGMS1-210ENST00000619438 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.11■■□□□ 1.77
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SGMS1-210ENST00000619438 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.11■■□□□ 1.77
SGMS1-210ENST00000619438 RAB11FIP3O75154 756 aa26.1■■□□□ 1.77
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SGMS1-210ENST00000619438 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
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SGMS1-210ENST00000619438 BCAMP50895 628 aa26.04■■□□□ 1.76
SGMS1-210ENST00000619438 ATP2B3Q16720 1220 aa26.04■■□□□ 1.76
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SGMS1-210ENST00000619438 USP26Q9BXU7 913 aa26.04■■□□□ 1.76
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
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SGMS1-210ENST00000619438 SCARF1Q14162 830 aa26.03■■□□□ 1.76
SGMS1-210ENST00000619438 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa26.03■■□□□ 1.76
SGMS1-210ENST00000619438 KLRG1Q96E93 195 aa26.03■■□□□ 1.76
SGMS1-210ENST00000619438 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF609O15014 1411 aa26.02■■□□□ 1.76
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.02■■□□□ 1.76
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