RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613922.1

CCL3-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL3, Length 778 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3-204ENST00000613922 FKBP1BP68106 108 aa21.55■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.55■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 LRRC24Q50LG9 513 aa21.54■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.54■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 CCDC102AQ96A19 550 aa21.54■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 ZIC5Q96T25 663 aa21.54■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.54■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 CA12O43570 354 aa21.53■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.53■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 SLC10A3P09131 477 aa21.52■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.52■■□□□ 1.04
CCL3-204ENST00000613922 GYG1P46976 350 aa21.51■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 DLGAP5Q15398 846 aa21.51■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 PDE8BO95263 885 aa21.5■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 METTL24Q5JXM2 366 aa21.5■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.5■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.5■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.5■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 JAG2Q9Y219 1238 aa21.5■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.49■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 F8W031 263 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 CFAP100Q494V2 611 aa21.48■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 MOB2Q70IA6 237 aa21.48■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.48■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.48■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 TSKSQ9UJT2 592 aa21.48■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.48■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.47■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 SPDYE6P0CI01 402 aa21.47■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.47■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 KIF16BQ96L93 1317 aa21.47■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 EYA2O00167 538 aa21.46■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 FGFR2P21802 821 aa21.46■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 NF2P35240 595 aa21.46■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 MIER1Q8N108 512 aa21.46■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CCL3-204ENST00000613922 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.45■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 CAPN15O75808 1086 aa21.45■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.45■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.45■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 MYO1BO43795 1136 aa21.44■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.44■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 VPS37DQ86XT2 251 aa21.44■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 CSRNP1Q96S65 589 aa21.44■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.44■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.44■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 FBXO3Q9UK99 471 aa21.44■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.44■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.44■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 AOX1Q06278 1338 aa21.44■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 CLRN2A0PK11 232 aa21.42■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 CIAO1O76071 339 aa21.42■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 BCAMP50895 628 aa21.42■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.42■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.42■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 MEIS3Q99687 375 aa21.42■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.41■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 RNF186Q9NXI6 227 aa21.41■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 LAMB1P07942 1786 aa21.41■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 SLC5A1P13866 664 aa21.4■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 GRIK5Q16478 980 aa21.4■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 MAP3K11Q16584 847 aa21.4■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.4■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.4■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 LPIN2Q92539 896 aa21.4■■□□□ 1.02
CCL3-204ENST00000613922 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CCL3-204ENST00000613922 CRKP46108 304 aa21.39■■□□□ 1.01
CCL3-204ENST00000613922 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CCL3-204ENST00000613922 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CCL3-204ENST00000613922 VEZTQ9HBM0 779 aa21.39■■□□□ 1.01
CCL3-204ENST00000613922 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CCL3-204ENST00000613922 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CCL3-204ENST00000613922 BCAR3O75815 825 aa21.38■■□□□ 1.01
CCL3-204ENST00000613922 GNAI3P08754 354 aa21.38■■□□□ 1.01
CCL3-204ENST00000613922 TRIM27P14373 513 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms