RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612516.4

CCL23-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 23, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL23, Length 569 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23-201ENST00000612516 SLC5A1P13866 664 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 CDCA5Q96FF9 252 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 HHIPL1Q96JK4 782 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 SIL1Q9H173 461 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 FBXO3Q9UK99 471 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 JAG2Q9Y219 1238 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 ZNF609O15014 1411 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 WNT10BO00744 389 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 GNAI2P04899 355 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 TRIM27P14373 513 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 MAP2K2P36507 400 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 IL15P40933 162 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 MFSD14BQ5SR56 506 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 RGMBQ6NW40 437 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 DLK2Q6UY11 383 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 LPIN2Q92539 896 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 CCDC102AQ96A19 550 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 MEIS3Q99687 375 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 ZBED9Q6R2W3 1325 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 FAM205AQ6ZU69 1335 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 PSME4Q14997 1843 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 SRGAP3O43295 1099 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 AOC2O75106 756 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 CIAO1O76071 339 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 MS4A1P11836 297 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 BCAMP50895 628 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 FKBP1BP68106 108 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 NOGQ13253 232 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 ATP2B3Q16720 1220 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 CFAP100Q494V2 611 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 ARMC9Q7Z3E5 817 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 CERS5Q8N5B7 392 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 VEZTQ9HBM0 779 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 WBP1LQ9NX94 342 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 IRS2Q9Y4H2 1338 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 CLRN2A0PK11 232 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 FOXN1O15353 648 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 TNFAIP1Q13829 316 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 PRKG1Q13976 671 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 GORABQ5T7V8 394 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 ITPRIPQ8IWB1 547 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 TNS4Q8IZW8 715 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 WDR66Q8TBY9 1149 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 TMOD2Q9NZR1 351 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 MAST3O60307 1309 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 SPDYE2BA6NHP3 402 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 UBE2Q2LH0YL09 131 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 CA12O43570 354 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 SPDYE6P0CI01 402 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 FGFR2P21802 821 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 TNNI2P48788 182 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 LBX1P52954 281 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 IFFO2Q5TF58 517 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 ATG9AQ7Z3C6 839 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 TMEM57Q8N5G2 664 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 VGLL2Q8N8G2 317 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 TEKT1Q969V4 418 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 NEUROD6Q96NK8 337 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 DEFB129Q9H1M3 183 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 COPRSQ9NQ92 184 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL23-201ENST00000612516 CRKP46108 304 aa7.52□□□□□ -1.21
CCL23-201ENST00000612516 TIMM10P62072 90 aa7.52□□□□□ -1.21
CCL23-201ENST00000612516 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CCL23-201ENST00000612516 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CCL23-201ENST00000612516 SLC10A4Q96EP9 437 aa7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms