RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603055.1

NLRC3-203, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

TSL 5

Gene NLRC3, Length 1,158 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-203ENST00000603055 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.84■■□□□ 1.25
NLRC3-203ENST00000603055 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.84■■□□□ 1.25
NLRC3-203ENST00000603055 JAG2Q9Y219 1238 aa22.84■■□□□ 1.25
NLRC3-203ENST00000603055 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.84■■□□□ 1.25
NLRC3-203ENST00000603055 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
NLRC3-203ENST00000603055 USP44Q9H0E7 712 aa22.83■■□□□ 1.25
NLRC3-203ENST00000603055 F8W031 263 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.82■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 CCER2I3L3R5 266 aa22.82■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 GYG1P46976 350 aa22.82■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 DLGAP5Q15398 846 aa22.82■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.82■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 ABHD8Q96I13 439 aa22.82■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.82■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 CSRNP1Q96S65 589 aa22.81■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.81■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.81■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.81■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.8■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 LRRC24Q50LG9 513 aa22.8■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.8■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 NF2P35240 595 aa22.79■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 CFAP100Q494V2 611 aa22.79■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.79■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 RNF186Q9NXI6 227 aa22.79■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.79■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 AOX1Q06278 1338 aa22.78■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.77■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.77■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 TRPA1O75762 1119 aa22.77■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 SPDYE6P0CI01 402 aa22.77■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.77■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.77■■□□□ 1.24
NLRC3-203ENST00000603055 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 PRKG1Q13976 671 aa22.76■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 METTL24Q5JXM2 366 aa22.76■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.76■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.76■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 CLRN2A0PK11 232 aa22.75■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 PDE8BO95263 885 aa22.75■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.75■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 MYO1BO43795 1136 aa22.74■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.74■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 FZD1Q9UP38 647 aa22.74■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.74■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.73■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.73■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.73■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 VEZTQ9HBM0 779 aa22.72■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 DGKZQ13574 1117 aa22.71■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 GRIK5Q16478 980 aa22.71■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.71■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 VPS37DQ86XT2 251 aa22.71■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.71■■□□□ 1.23
NLRC3-203ENST00000603055 EYA2O00167 538 aa22.7■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 FGFR2P21802 821 aa22.7■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 MAP3K11Q16584 847 aa22.7■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 BCAMP50895 628 aa22.69■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.69■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 KIF16BQ96L93 1317 aa22.68■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.68■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 TM4SF4P48230 202 aa22.68■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 RASA3Q14644 834 aa22.68■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.68■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 CRKP46108 304 aa22.67■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.67■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 SPRYD7Q5W111 196 aa22.66■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.66■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 TNFAIP1Q13829 316 aa22.65■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.65■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NLRC3-203ENST00000603055 TBC1D8O95759 1140 aa22.64■■□□□ 1.21
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