RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592826.1

APBA3-208, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-208	ENST00000592826	CNTROB	Q8N137	903 aa		27.84	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	FBXW7	Q969H0	707 aa		27.84	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	ATP2B3	Q16720	1220 aa		27.83	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	CEP85	Q6P2H3	762 aa		27.83	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	OGFOD1	Q8N543	542 aa		27.83	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	AIDA	Q96BJ3	306 aa		27.82	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	VEGFB	P49765	207 aa		27.81	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		27.81	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		27.81	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		27.81	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		27.8	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	ZBTB22	O15209	634 aa		27.79	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	FOXN1	O15353	648 aa		27.79	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	HMMR	O75330	724 aa		27.79	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		27.79	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	BCAM	P50895	628 aa		27.78	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	TFCP2	Q12800	502 aa		27.78	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		27.78	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	RASSF10	A6NK89	507 aa		27.77	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		27.77	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		27.77	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		27.77	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		27.77	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		27.77	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		27.77	■■■□□ 2.04
APBA3-208	ENST00000592826	SHTN1	A0MZ66	631 aa		27.76	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	GPR108	Q9NPR9	543 aa		27.76	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		27.75	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	MXD3	Q9BW11	206 aa		27.75	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826		A0A1B0GUL7	405 aa		27.74	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	SEMA3E	O15041	775 aa		27.74	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		27.74	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		27.74	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	WBP1L	Q9NX94	342 aa		27.74	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	TIMM10	P62072	90 aa		27.73	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		27.72	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	CERS5	Q8N5B7	392 aa		27.72	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		27.72	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		27.71	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	XAGE2	Q96GT9	111 aa		27.71	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		27.71	■■■□□ 2.03
APBA3-208	ENST00000592826	EGFR	P00533	1210 aa		27.7	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	CCDC102B	Q68D86	513 aa		27.7	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		27.7	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		27.7	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	SCARF1	Q14162	830 aa		27.69	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	GORAB	Q5T7V8	394 aa		27.68	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	JAG2	Q9Y219	1238 aa		27.68	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		27.68	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		27.67	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	ADORA1	P30542	326 aa		27.67	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	PHKA1	P46020	1223 aa		27.67	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	AAMP	Q13685	434 aa		27.67	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	TNNI3K	Q59H18	835 aa		27.67	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		27.67	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	MRI	Q9BWK5	157 aa		27.67	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		27.67	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		27.67	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		27.67	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	WNT10B	O00744	389 aa		27.66	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	RAB11FIP3	O75154	756 aa		27.66	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	DLGAP5	Q15398	846 aa		27.66	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	MAST3	O60307	1309 aa		27.66	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	LBX1	P52954	281 aa		27.65	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		27.65	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	SULF1	Q8IWU6	871 aa		27.65	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		27.65	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		27.65	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826		F8W031	263 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		27.64	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	ECE1	P42892	770 aa		27.64	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		27.64	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	GGA3	Q9NZ52	723 aa		27.64	■■■□□ 2.02
APBA3-208	ENST00000592826	MYO1B	O43795	1136 aa		27.63	■■■□□ 2.01
APBA3-208	ENST00000592826	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		27.63	■■■□□ 2.01

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