RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.72■■□□□ 1.39
PGS1-211ENST00000589425 POLD1P28340 1107 aa23.71■■□□□ 1.39
PGS1-211ENST00000589425 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.71■■□□□ 1.39
PGS1-211ENST00000589425 SLX4Q8IY92 1834 aa23.71■■□□□ 1.39
PGS1-211ENST00000589425 CACNA1SQ13698 1873 aa23.71■■□□□ 1.39
PGS1-211ENST00000589425 A0A0G2JLW4 131 aa23.71■■□□□ 1.39
PGS1-211ENST00000589425 WASHC4Q2M389 1173 aa23.71■■□□□ 1.39
PGS1-211ENST00000589425 MAP4K1Q92918 833 aa23.71■■□□□ 1.39
PGS1-211ENST00000589425 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PGS1-211ENST00000589425 PALD1Q9ULE6 856 aa23.71■■□□□ 1.39
PGS1-211ENST00000589425 MAST3O60307 1309 aa23.7■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 M0R2C6 588 aa23.7■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 ZBTB22O15209 634 aa23.7■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 KCNA3P22001 575 aa23.7■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 HSPA4P34932 840 aa23.7■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.7■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.7■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 APPBP2Q92624 585 aa23.7■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 PDE6AP16499 860 aa23.69■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 MAP3K12Q12852 859 aa23.69■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 UBE3CQ15386 1083 aa23.69■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.69■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 ABCF2Q9UG63 623 aa23.69■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.69■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 DPEP1P16444 411 aa23.69■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 MCCP23508 829 aa23.69■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.69■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.68■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.68■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 CD209Q9NNX6 404 aa23.68■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.68■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 MYH7P12883 1935 aa23.68■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 DOCK2Q92608 1830 aa23.67■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 ILDR2Q71H61 639 aa23.67■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 MAGEB6Q8N7X4 407 aa23.67■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 JAG2Q9Y219 1238 aa23.67■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 RIMBP2O15034 1052 aa23.67■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 NECTIN1Q15223 517 aa23.66■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 VPS53Q5VIR6 699 aa23.66■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.65■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 IL1R1P14778 569 aa23.65■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 TTLL6Q8N841 843 aa23.65■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 ANAPC15P60006 121 aa23.65■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 RASEFQ8IZ41 740 aa23.65■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 RAI14Q9P0K7 980 aa23.65■■□□□ 1.38
PGS1-211ENST00000589425 TGFB2P61812 414 aa23.64■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.64■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.63■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 C21orf2O43822 256 aa23.63■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 PTGER2P43116 358 aa23.63■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 IL17RAQ96F46 866 aa23.63■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.63■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 GPAA1O43292 621 aa23.63■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 SLC4A3P48751 1232 aa23.63■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 RABEP1Q15276 862 aa23.63■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 ZNF384Q8TF68 577 aa23.62■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 KCNB2Q92953 911 aa23.62■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.62■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 PRDX5P30044 214 aa23.61■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.61■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.61■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.61■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 SNED1Q8TER0 1413 aa23.61■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 FOXP2O15409 715 aa23.61■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.61■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 EYA3Q99504 573 aa23.61■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.61■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 COA1Q9GZY4 146 aa23.61■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.6■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 SLC27A2O14975 620 aa23.6■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.6■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 CYP7A1P22680 504 aa23.59■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 DOK7Q18PE1 504 aa23.59■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.59■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 MECOMQ03112 1051 aa23.59■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 AIDAQ96BJ3 306 aa23.59■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 PIM2Q9P1W9 311 aa23.59■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 GRIK5Q16478 980 aa23.58■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.58■■□□□ 1.37
PGS1-211ENST00000589425 BECN1Q14457 450 aa23.57■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.57■■□□□ 1.36
PGS1-211ENST00000589425 SNX21Q969T3 373 aa23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms