RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589054.5

NEDD4L-225, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene NEDD4L, Length 1,033 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-225ENST00000589054 PRKG1Q13976 671 aa27.04■■□□□ 1.92
NEDD4L-225ENST00000589054 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
NEDD4L-225ENST00000589054 CNNM1Q9NRU3 951 aa27.03■■□□□ 1.92
NEDD4L-225ENST00000589054 HDAC9Q9UKV0 1011 aa27.03■■□□□ 1.92
NEDD4L-225ENST00000589054 UTYO14607 1347 aa27.02■■□□□ 1.92
NEDD4L-225ENST00000589054 MMP14P50281 582 aa27.01■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 ZNF804AQ7Z570 1209 aa27.01■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 MTMR14Q8NCE2 650 aa27.01■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa27.01■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 DLGAP5Q15398 846 aa27■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 TAF7LQ5H9L4 462 aa27■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 ANKRD44Q8N8A2 993 aa27■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 GYG1P46976 350 aa26.99■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 RGS19P49795 217 aa26.99■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 CFAP100Q494V2 611 aa26.99■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.99■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.99■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 CLRN2A0PK11 232 aa26.98■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 LDLRAD1Q5T700 205 aa26.98■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.98■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 SSC5DA1L4H1 1573 aa26.97■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.97■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 SPDYE6P0CI01 402 aa26.97■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 LRRC24Q50LG9 513 aa26.97■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.96■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 TBC1D8O95759 1140 aa26.96■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 SLFN5Q08AF3 891 aa26.96■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 UBE4AQ14139 1066 aa26.96■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 GRIK5Q16478 980 aa26.96■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa26.96■■□□□ 1.91
NEDD4L-225ENST00000589054 NF2P35240 595 aa26.95■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 TM4SF4P48230 202 aa26.95■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.95■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 USP44Q9H0E7 712 aa26.94■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 ARMC9Q7Z3E5 817 aa26.93■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 CLMNQ96JQ2 1002 aa26.93■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 E9PSI1 815 aa26.92■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.92■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 AKAP11Q9UKA4 1901 aa26.92■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.91■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 SPRYD7Q5W111 196 aa26.91■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.91■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.91■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 MAP3K11Q16584 847 aa26.9■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 VEZTQ9HBM0 779 aa26.9■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
NEDD4L-225ENST00000589054 PTPRCP08575 1304 aa26.89■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.89■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.891e-7■■■■□ 20.1
NEDD4L-225ENST00000589054 RASA3Q14644 834 aa26.88■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 USP2O75604 605 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 GJA5P36382 358 aa26.86■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.86■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 METTL24Q5JXM2 366 aa26.86■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.86■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 GPR25O00155 361 aa26.85■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 BCAMP50895 628 aa26.85■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 SLC10A4Q96EP9 437 aa26.85■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 TEPSINQ96N21 525 aa26.85■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 SERPINA10Q9UK55 444 aa26.85■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 MYO1BO43795 1136 aa26.84■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 PDE8BO95263 885 aa26.84■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 WNK4Q96J92 1243 aa26.84■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 FGFR2P21802 821 aa26.83■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 CRKP46108 304 aa26.83■■□□□ 1.89
NEDD4L-225ENST00000589054 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.884e-7■■□□□ 12.1
NEDD4L-225ENST00000589054 SOX10P56693 466 aa26.82■■□□□ 1.88
NEDD4L-225ENST00000589054 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.82■■□□□ 1.88
NEDD4L-225ENST00000589054 CFHR5Q9BXR6 569 aa26.82■■□□□ 1.88
NEDD4L-225ENST00000589054 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
NEDD4L-225ENST00000589054 SREBF2Q12772 1141 aa26.81■■□□□ 1.88
NEDD4L-225ENST00000589054 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.81■■□□□ 1.88
NEDD4L-225ENST00000589054 ECM29Q5VYK3 1845 aa26.81■■□□□ 1.88
NEDD4L-225ENST00000589054 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.8■■□□□ 1.88
NEDD4L-225ENST00000589054 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.8■■□□□ 1.88
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