RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583704.1

TTC19-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, humanhuman

TSL 2

Gene TTC19, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19-210ENST00000583704 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 KAZALD1Q96I82 304 aa28.21■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 CCDC85CA6NKD9 419 aa28.2■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 NF2P35240 595 aa28.2■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 JAG2Q9Y219 1238 aa28.2■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 F8W031 263 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 DGKZQ13574 1117 aa28.19■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 SLFN5Q08AF3 891 aa28.18■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 DLGAP5Q15398 846 aa28.18■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 UTYO14607 1347 aa28.18■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa28.17■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 PRKG1Q13976 671 aa28.16■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 MTMR14Q8NCE2 650 aa28.15■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.15■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 PTPRCP08575 1304 aa28.15■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 UBE4AQ14139 1066 aa28.14■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 CFAP100Q494V2 611 aa28.14■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.14■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 ARAP2Q8WZ64 1704 aa28.14■■■□□ 2.1
TTC19-210ENST00000583704 GYG1P46976 350 aa28.13■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 DEFB129Q9H1M3 183 aa28.13■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 CLRN2A0PK11 232 aa28.12■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 SPDYE2BA6NHP3 402 aa28.12■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 SPDYE6P0CI01 402 aa28.12■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 ARMC9Q7Z3E5 817 aa28.12■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 ANKRD44Q8N8A2 993 aa28.12■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 FZD1Q9UP38 647 aa28.12■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa28.12■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 AOX1Q06278 1338 aa28.11■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 FAM205AQ6ZU69 1335 aa28.11■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 SSC5DA1L4H1 1573 aa28.11■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 MYO1BO43795 1136 aa28.1■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 MROH5Q6ZUA9 1318 aa28.1■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 MFSD14BQ5SR56 506 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 VEZTQ9HBM0 779 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 LRRC24Q50LG9 513 aa28.08■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa28.08■■■□□ 2.09
TTC19-210ENST00000583704 LDLRAD1Q5T700 205 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 METTL24Q5JXM2 366 aa28.06■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 KLHDC4Q8TBB5 520 aa28.06■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 USP44Q9H0E7 712 aa28.06■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 TM4SF4P48230 202 aa28.05■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 TBC1D8O95759 1140 aa28.04■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.04■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 VPS37DQ86XT2 251 aa28.04■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 MIER1Q8N108 512 aa28.04■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 VGLL2Q8N8G2 317 aa28.04■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.04■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 SREBF2Q12772 1141 aa28.03■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 SPRYD7Q5W111 196 aa28.03■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 SERPINA10Q9UK55 444 aa28.03■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 MAP3K11Q16584 847 aa28.02■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 FBXO33Q7Z6M2 555 aa28.02■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
TTC19-210ENST00000583704 PDE8BO95263 885 aa28.01■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 RGS19P49795 217 aa28.01■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 RASA3Q14644 834 aa28.01■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 CLMNQ96JQ2 1002 aa28.01■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 GRIK5Q16478 980 aa28■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa28■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 SPDYE2Q495Y8 402 aa28■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 CAVIN4Q5BKX8 364 aa28■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 SLC10A4Q96EP9 437 aa28■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 OTOFQ9HC10 1997 aa28■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 LAMB1P07942 1786 aa27.99■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 CRKP46108 304 aa27.98■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 TNFAIP1Q13829 316 aa27.98■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 BCAMP50895 628 aa27.97■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 MYH13Q9UKX3 1938 aa27.96■■■□□ 2.07
TTC19-210ENST00000583704 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms