RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579814.1

LIMD2-208, Transcript of LIM domain containing 2, human

TSL 2

Gene LIMD2, Length 709 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIMD2-208	ENST00000579814	JAG2	Q9Y219	1238 aa		32.66	■■■□□ 2.82
LIMD2-208	ENST00000579814	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		32.65	■■■□□ 2.82
LIMD2-208	ENST00000579814	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		32.65	■■■□□ 2.82
LIMD2-208	ENST00000579814	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		32.65	■■■□□ 2.82
LIMD2-208	ENST00000579814	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		32.65	■■■□□ 2.82
LIMD2-208	ENST00000579814	WNT10B	O00744	389 aa		32.64	■■■□□ 2.82
LIMD2-208	ENST00000579814	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
LIMD2-208	ENST00000579814	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		32.64	■■■□□ 2.82
LIMD2-208	ENST00000579814	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
LIMD2-208	ENST00000579814	COPRS	Q9NQ92	184 aa		32.64	■■■□□ 2.82
LIMD2-208	ENST00000579814	SRGAP3	O43295	1099 aa		32.63	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	FGFR2	P21802	821 aa		32.63	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	ECE1	P42892	770 aa		32.63	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	LPIN2	Q92539	896 aa		32.63	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814		F8W031	263 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	SLC5A1	P13866	664 aa		32.62	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	MTX1	Q13505	466 aa		32.62	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	PSME4	Q14997	1843 aa		32.61	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	BCAM	P50895	628 aa		32.61	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	DLGAP5	Q15398	846 aa		32.61	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		32.61	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		32.6	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		32.6	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	CAPNS2	Q96L46	248 aa		32.59	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		32.58	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	CDCA5	Q96FF9	252 aa		32.58	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
LIMD2-208	ENST00000579814	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
LIMD2-208	ENST00000579814	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		32.57	■■■□□ 2.8
LIMD2-208	ENST00000579814	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		32.57	■■■□□ 2.8
LIMD2-208	ENST00000579814	GRM1	Q13255	1194 aa		32.56	■■■□□ 2.8
LIMD2-208	ENST00000579814	ATP2B3	Q16720	1220 aa		32.56	■■■□□ 2.8
LIMD2-208	ENST00000579814	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		32.56	■■■□□ 2.8
LIMD2-208	ENST00000579814		A0A1B0GUL6	1792 aa		32.55	■■■□□ 2.8
LIMD2-208	ENST00000579814	HUNK	P57058	714 aa		32.55	■■■□□ 2.8
LIMD2-208	ENST00000579814	CFAP100	Q494V2	611 aa		32.55	■■■□□ 2.8
LIMD2-208	ENST00000579814	MYO1B	O43795	1136 aa		32.54	■■■□□ 2.8
LIMD2-208	ENST00000579814	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	32.54	■■■□□ 2.8
LIMD2-208	ENST00000579814	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
LIMD2-208	ENST00000579814	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
LIMD2-208	ENST00000579814	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
LIMD2-208	ENST00000579814	MS4A1	P11836	297 aa		32.53	■■■□□ 2.8
LIMD2-208	ENST00000579814	RLBP1	P12271	317 aa		32.53	■■■□□ 2.8
LIMD2-208	ENST00000579814	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
LIMD2-208	ENST00000579814	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		32.51	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	SPDYE6	P0CI01	402 aa		32.51	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		32.51	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		32.5	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	AIDA	Q96BJ3	306 aa		32.5	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		32.5	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		32.49	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	MAP2K2	P36507	400 aa		32.49	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	FKBP1B	P68106	108 aa		32.49	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	32.49	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		32.49	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		32.49	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		32.49	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	NF2	P35240	595 aa		32.48	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	ATP8B2	P98198	1209 aa		32.47	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	TFCP2	Q12800	502 aa		32.47	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	RGMB	Q6NW40	437 aa		32.47	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		32.47	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	PANK1	Q8TE04	598 aa		32.47	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	WBP1L	Q9NX94	342 aa		32.47	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		32.47	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	CLRN2	A0PK11	232 aa		32.45	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	CRK	P46108	304 aa		32.45	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	TIMM10	P62072	90 aa		32.45	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	CCDC102A	Q96A19	550 aa		32.45	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		32.45	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		32.45	■■■□□ 2.79
LIMD2-208	ENST00000579814	AOC2	O75106	756 aa		32.44	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	GRIK5	Q16478	980 aa		32.44	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	VEZT	Q9HBM0	779 aa		32.44	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	NOG	Q13253	232 aa		32.43	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	POLA2	Q14181	598 aa		32.43	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		32.43	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	MRI	Q9BWK5	157 aa		32.43	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		32.43	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814		A0A1B0GUL7	405 aa		32.42	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	SEMA3E	O15041	775 aa		32.42	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	ADORA1	P30542	326 aa		32.42	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	PHKA1	P46020	1223 aa		32.42	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	SSH3	Q8TE77	659 aa		32.42	■■■□□ 2.78

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