RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575514.5

EDC4-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 4, humanhuman

TSL 5

Gene EDC4, Length 1,016 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4-211ENST00000575514 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.21■■□□□ 1.15
EDC4-211ENST00000575514 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.21■■□□□ 1.15
EDC4-211ENST00000575514 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 USP44Q9H0E7 712 aa22.2■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.2■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 DLGAP5Q15398 846 aa22.19■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 JAG2Q9Y219 1238 aa22.19■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.18■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 F8W031 263 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 MOB2Q70IA6 237 aa22.18■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.18■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.18■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.17■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 NF2P35240 595 aa22.17■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 GYG1P46976 350 aa22.17■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 LRRC24Q50LG9 513 aa22.17■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 METTL24Q5JXM2 366 aa22.16■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.15■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.15■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 CFAP100Q494V2 611 aa22.15■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.15■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.15■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.15■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.14■■□□□ 1.14
EDC4-211ENST00000575514 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.14■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.13■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 MYO1BO43795 1136 aa22.13■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 SPDYE6P0CI01 402 aa22.13■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.13■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.13■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 ABHD8Q96I13 439 aa22.13■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 CSRNP1Q96S65 589 aa22.13■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.13■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 PDE8BO95263 885 aa22.12■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.12■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 VPS37DQ86XT2 251 aa22.12■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 RNF186Q9NXI6 227 aa22.12■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.11■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.11■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 CLRN2A0PK11 232 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 TRPA1O75762 1119 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 PRKG1Q13976 671 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 AOX1Q06278 1338 aa22.09■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 VEZTQ9HBM0 779 aa22.09■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.09■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 EYA2O00167 538 aa22.08■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
EDC4-211ENST00000575514 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.08■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 KIF16BQ96L93 1317 aa22.07■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 FGFR2P21802 821 aa22.07■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.07■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 BCAMP50895 628 aa22.06■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.06■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 FZD1Q9UP38 647 aa22.06■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 CRKP46108 304 aa22.05■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.05■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.05■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.05■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.05■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 DGKZQ13574 1117 aa22.04■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 RASA3Q14644 834 aa22.04■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 GRIK5Q16478 980 aa22.04■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 MAP3K11Q16584 847 aa22.04■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.04■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.04■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 SLC5A1P13866 664 aa22.03■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 TNFAIP1Q13829 316 aa22.03■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 LPIN2Q92539 896 aa22.03■■□□□ 1.12
EDC4-211ENST00000575514 SIL1Q9H173 461 aa22.03■■□□□ 1.12
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