RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 CFHR5Q9BXR6 569 aa17.45■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 JAG2Q9Y219 1238 aa17.45■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 F6X3S4 739 aa17.44■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 ARMC9Q7Z3E5 817 aa17.44■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 DEFB129Q9H1M3 183 aa17.44■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 CACNA1FO60840 1977 aa17.44■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 OTOFQ9HC10 1997 aa17.44■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 IL16Q14005 1332 aa17.44■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 F8W031 263 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 VAMP4O75379 141 aa17.43■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 KCNJ4P48050 445 aa17.43■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 SREBF2Q12772 1141 aa17.43■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 MTMR14Q8NCE2 650 aa17.43■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 MYH16Q9H6N6 1097 aa17.43■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 CLRN2A0PK11 232 aa17.42■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa17.42■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP17.42■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 IL1R1P14778 569 aa17.42■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 MMP14P50281 582 aa17.42■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 DLGAP5Q15398 846 aa17.42■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 MAP3K11Q16584 847 aa17.42■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 SPDYE2BA6NHP3 402 aa17.41■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 FKTNO75072 461 aa17.41■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 SPDYE6P0CI01 402 aa17.41■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 GJA5P36382 358 aa17.41■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 CAP1Q01518 475 aa17.41■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 CFAP100Q494V2 611 aa17.41■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 BEND3Q5T5X7 828 aa17.41■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 WNK4Q96J92 1243 aa17.41■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 IFNL1Q8IU54 200 aa17.4■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 CDAN1Q8IWY9 1227 aa17.4■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 ARAP2Q8WZ64 1704 aa17.39■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 LMBR1LQ6UX01 489 aa17.39■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 CHMP3Q9Y3E7 222 aa17.39■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 SLC10A4Q96EP9 437 aa17.38■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 VEZTQ9HBM0 779 aa17.38■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 CENPFP49454 3210 aa17.38■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 USP2O75604 605 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 OTOP1Q7RTM1 612 aa17.37■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF804AQ7Z570 1209 aa17.37■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa17.37■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 BRCA2P51587 3418 aa17.37■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 PLIN1O60240 522 aa17.36■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 RASA3Q14644 834 aa17.36■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 KAZALD1Q96I82 304 aa17.36■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 PTPN18Q99952 460 aa17.36■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 TRIM17Q9Y577 477 aa17.36■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 POTEFA5A3E0 1075 aa17.35■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 ALDH1A1P00352 501 aa17.35■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 GRIK5Q16478 980 aa17.35■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 FAM205AQ6ZU69 1335 aa17.35■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 GRM8O00222 908 aa17.34■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 GYG1P46976 350 aa17.34■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 CRHR2Q13324 411 aa17.34■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa17.34■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 CD99L2Q8TCZ2 262 aa17.34■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.34■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 TEPSINQ96N21 525 aa17.34■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 PCDH10Q9P2E7 1040 aa17.34■□□□□ 0.37
SPNS3-202ENST00000572078 INHBEP58166 350 aa17.33■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 SPDYE2Q495Y8 402 aa17.33■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 WDR63Q8IWG1 891 aa17.33■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 ELP3Q9H9T3 547 aa17.33■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 MYO1BO43795 1136 aa17.32■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP17.32■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 CCDC57Q2TAC2 916 aa17.32■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa17.32■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 MFSD14BQ5SR56 506 aa17.32■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 SUCLG2Q96I99 432 aa17.32■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 MRS2Q9HD23 443 aa17.32■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 CNNM1Q9NRU3 951 aa17.32■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa17.32■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 UNCXA6NJT0 531 aa17.31■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 IREB2P48200 963 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SPNS3-202ENST00000572078 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms