RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569573.1

E2F4-213, Transcript of E2F transcription factor 4, human

TSL 3

Gene E2F4, Length 849 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
E2F4-213	ENST00000569573	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		32.46	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	PLIN1	O60240	522 aa		32.45	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	CERS5	Q8N5B7	392 aa		32.45	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		32.45	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		32.44	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	GPR25	O00155	361 aa		32.43	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	GRM8	O00222	908 aa		32.43	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	IL1R1	P14778	569 aa		32.43	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		32.43	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		32.43	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	32.42	■■■□□ 2.78	1e-6	■■□□□ 11.6
E2F4-213	ENST00000569573	CFAP100	Q494V2	611 aa		32.42	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		32.42	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		32.42	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		32.42	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		32.42	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	SLC34A2	O95436	690 aa		32.41	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	SPRYD7	Q5W111	196 aa		32.41	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	VEZT	Q9HBM0	779 aa		32.41	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	FZD1	Q9UP38	647 aa		32.41	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	JAG2	Q9Y219	1238 aa		32.41	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	CLRN2	A0PK11	232 aa		32.4	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		32.4	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	ALDH1A1	P00352	501 aa		32.39	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		32.39	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		32.39	■■■□□ 2.78
E2F4-213	ENST00000569573	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		32.38	■■■□□ 2.77
E2F4-213	ENST00000569573	FKTN	O75072	461 aa		32.38	■■■□□ 2.77
E2F4-213	ENST00000569573	SPDYE6	P0CI01	402 aa		32.38	■■■□□ 2.77
E2F4-213	ENST00000569573	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		32.38	■■■□□ 2.77
E2F4-213	ENST00000569573		A0A1B0GUL6	1792 aa		32.37	■■■□□ 2.77
E2F4-213	ENST00000569573	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
E2F4-213	ENST00000569573	ALDH1L1	O75891	902 aa		32.36	■■■□□ 2.77
E2F4-213	ENST00000569573	INHBE	P58166	350 aa		32.36	■■■□□ 2.77
E2F4-213	ENST00000569573	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
E2F4-213	ENST00000569573	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		32.36	■■■□□ 2.77
E2F4-213	ENST00000569573	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
E2F4-213	ENST00000569573	MAP3K11	Q16584	847 aa		32.35	■■■□□ 2.77
E2F4-213	ENST00000569573	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		32.35	■■■□□ 2.77
E2F4-213	ENST00000569573	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		32.35	■■■□□ 2.77
E2F4-213	ENST00000569573	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
E2F4-213	ENST00000569573	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
E2F4-213	ENST00000569573	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		32.34	■■■□□ 2.77
E2F4-213	ENST00000569573	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
E2F4-213	ENST00000569573	UBE4A	Q14139	1066 aa		32.32	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		32.32	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	WNK4	Q96J92	1243 aa		32.32	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		32.32	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	TNFAIP1	Q13829	316 aa		32.31	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	IFNL1	Q8IU54	200 aa		32.31	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		32.31	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		32.31	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	UNCX	A6NJT0	531 aa		32.3	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	GYG1	P46976	350 aa		32.3	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	RASA3	Q14644	834 aa		32.3	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		32.29	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		32.28	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	VPS37D	Q86XT2	251 aa		32.28	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	SUCLG2	Q96I99	432 aa		32.28	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		32.27	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		32.27	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	AOX1	Q06278	1338 aa		32.26	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		32.26	■■■□□ 2.76
E2F4-213	ENST00000569573	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		32.26	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		32.24	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	TRIM17	Q9Y577	477 aa		32.24	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	32.23	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	TNNI2	P48788	182 aa		32.22	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		32.21	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		32.21	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		32.2	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	CRK	P46108	304 aa		32.2	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	METTL24	Q5JXM2	366 aa		32.2	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	ERO1A	Q96HE7	468 aa		32.2	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	KAZALD1	Q96I82	304 aa		32.2	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	ELP3	Q9H9T3	547 aa		32.2	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
E2F4-213	ENST00000569573	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.3 ms