RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563545.1

CHTF18-214, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-214ENST00000563545 DGKZQ13574 1117 aa28.12■■■□□ 2.09
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CHTF18-214ENST00000563545 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CHTF18-214ENST00000563545 KAZALD1Q96I82 304 aa28.1■■■□□ 2.09
CHTF18-214ENST00000563545 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
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CHTF18-214ENST00000563545 MTMR14Q8NCE2 650 aa28.08■■■□□ 2.09
CHTF18-214ENST00000563545 JAG2Q9Y219 1238 aa28.08■■■□□ 2.09
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CHTF18-214ENST00000563545 ARMC9Q7Z3E5 817 aa28.06■■■□□ 2.08
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CHTF18-214ENST00000563545 DEFB129Q9H1M3 183 aa28.04■■■□□ 2.08
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CHTF18-214ENST00000563545 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa28.03■■■□□ 2.08
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CHTF18-214ENST00000563545 MYO1BO43795 1136 aa28.01■■■□□ 2.07
CHTF18-214ENST00000563545 SLFN5Q08AF3 891 aa28.01■■■□□ 2.07
CHTF18-214ENST00000563545 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
CHTF18-214ENST00000563545 ANKRD44Q8N8A2 993 aa28.01■■■□□ 2.07
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CHTF18-214ENST00000563545 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa28■■■□□ 2.07
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CHTF18-214ENST00000563545 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa27.94■■■□□ 2.06
CHTF18-214ENST00000563545 FBXO33Q7Z6M2 555 aa27.94■■■□□ 2.06
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CHTF18-214ENST00000563545 SLC10A4Q96EP9 437 aa27.94■■■□□ 2.06
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CHTF18-214ENST00000563545 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
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CHTF18-214ENST00000563545 SPDYE2Q495Y8 402 aa27.91■■■□□ 2.06
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CHTF18-214ENST00000563545 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
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CHTF18-214ENST00000563545 GRIK5Q16478 980 aa27.89■■■□□ 2.06
CHTF18-214ENST00000563545 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
CHTF18-214ENST00000563545 WNK4Q96J92 1243 aa27.89■■■□□ 2.06
CHTF18-214ENST00000563545 UNCXA6NJT0 531 aa27.88■■■□□ 2.05
CHTF18-214ENST00000563545 USP2O75604 605 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CHTF18-214ENST00000563545 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
CHTF18-214ENST00000563545 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa27.88■■■□□ 2.05
CHTF18-214ENST00000563545 OTOFQ9HC10 1997 aa27.88■■■□□ 2.05
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