RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 JAG2Q9Y219 1238 aa15.39■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 BCAMP50895 628 aa15.38■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 SULF1Q8IWU6 871 aa15.38■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 CERS5Q8N5B7 392 aa15.38■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM205AQ6ZU69 1335 aa15.38■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa15.37■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 F8W031 263 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 CELF2O95319 508 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 ATP2B3Q16720 1220 aa15.37■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF408Q9H9D4 720 aa15.37■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 ATP8B2P98198 1209 aa15.36■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 DLGAP5Q15398 846 aa15.36■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 NBPF9Q3BBW0 867 aa15.36■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 MFSD14BQ5SR56 506 aa15.36■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 CST9Q5W186 159 aa15.36■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 C1orf115Q9H7X2 142 aa15.36■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 ADM5C9JUS6 153 aa15.35■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 WNT10BO00744 389 aa15.35■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.35■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa15.35■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 AKAP2Q9Y2D5 859 aa15.35■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 CEP350Q5VT06 3117 aa15.35■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 TFCP2Q12800 502 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 POLA2Q14181 598 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 MVPQ14764 893 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 JMYQ8N9B5 988 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 CNTNAP1P78357 1384 aa15.34■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 RASSF10A6NK89 507 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 DLK2Q6UY11 383 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 SSH3Q8TE77 659 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 DDX19BQ9UMR2 479 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 COG6Q9Y2V7 657 aa15.33■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 MYO1BO43795 1136 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 SURF6O75683 361 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 TIMM10P62072 90 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 CFAP100Q494V2 611 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 MTMR14Q8NCE2 650 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 TLL2Q9Y6L7 1015 aa15.32■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 A0A1B0GUL7 405 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 VEGFBP49765 207 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 PDE3AQ14432 1141 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 C2orf69Q8N8R5 385 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 WDR66Q8TBY9 1149 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 CDCA5Q96FF9 252 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 NEUROD6Q96NK8 337 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 SERPINA10Q9UK55 444 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 A0A1B0GUL6 1792 aa15.31■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 SPDYE6P0CI01 402 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 ADORA1P30542 326 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 ECE1P42892 770 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 PHKA1P46020 1223 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 PSME4Q14997 1843 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC102BQ68D86 513 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 CEP85Q6P2H3 762 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 SAPCD2Q86UD0 394 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 XAGE2Q96GT9 111 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 DENND2AQ9ULE3 1009 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa15.3■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 SEMA3EO15041 775 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 CRKP46108 304 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 GORABQ5T7V8 394 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAST3O60307 1309 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 CLRN2A0PK11 232 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 HUNKP57058 714 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 GRM1Q13255 1194 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 GRIK5Q16478 980 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 HHIPL1Q96JK4 782 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 CAPNS2Q96L46 248 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 NF2P35240 595 aa15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms