RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
NEDD1-208ENST00000555806 FOXN1O15353 648 aa23.01■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 PDE8BO95263 885 aa23.01■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 MEIS3Q99687 375 aa23.01■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 WBP1LQ9NX94 342 aa23.01■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 EYA2O00167 538 aa23■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 AOC2O75106 756 aa23■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 VGLL2Q8N8G2 317 aa23■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 TRIM27P14373 513 aa22.99■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 DLGAP5Q15398 846 aa22.99■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.99■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.99■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.99■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 SIL1Q9H173 461 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 TNNQ9UQP3 1299 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 GNAI3P08754 354 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 MAP2K2P36507 400 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 IFFO2Q5TF58 517 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 CFAP100Q494V2 611 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 RGMBQ6NW40 437 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD1-208ENST00000555806 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.95■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 SLC5A1P13866 664 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 NF2P35240 595 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 FBXO3Q9UK99 471 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 MYO1BO43795 1136 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 CIAO1O76071 339 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 FGFR2P21802 821 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 BCAMP50895 628 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 FKBP1BP68106 108 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 NOGQ13253 232 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 TNS4Q8IZW8 715 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 LPIN2Q92539 896 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 SPDYE6P0CI01 402 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 LBX1P52954 281 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC102AQ96A19 550 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 CLRN2A0PK11 232 aa22.91■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 VEZTQ9HBM0 779 aa22.91■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.91■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 SRGAP3O43295 1099 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 ATP2B3Q16720 1220 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 MOB2Q70IA6 237 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 ZIC5Q96T25 663 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 COPRSQ9NQ92 184 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
NEDD1-208ENST00000555806 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 GNAI2P04899 355 aa22.89■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.89■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.89■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.88■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 SLC10A3P09131 477 aa22.88■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 AOX1Q06278 1338 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 MTX1Q13505 466 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 PRKG1Q13976 671 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 GRIK5Q16478 980 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 TSKSQ9UJT2 592 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 CRKP46108 304 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.86■■□□□ 1.25
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