RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.95■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 VIL1P09327 827 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.94■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.93■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 CCDC102BQ68D86 513 aa21.93■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 DPF2Q92785 391 aa21.93■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.93■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 MAST3O60307 1309 aa21.92■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 RRAGCQ9HB90 399 aa21.92■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.91■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.91■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 ADORA1P30542 326 aa21.91■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.91■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.91■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.9■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 PHKA1P46020 1223 aa21.9■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 DACT2Q5SW24 774 aa21.9■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
BRF1-209ENST00000547052 MYH7P12883 1935 aa21.89■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 USP17L8P0C7I0 530 aa21.89■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 EPHX2P34913 555 aa21.89■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 MICALL2Q8IY33 904 aa21.89■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.89■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.89■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.89■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.89■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 AK9Q5TCS8 1911 aa21.87■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 ZBTB22O15209 634 aa21.87■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 SCNN1DP51172 638 aa21.87■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.87■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 JAG2Q9Y219 1238 aa21.87■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.86■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.86■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.85■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 SLF2Q8IX21 1173 aa21.85■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 SPATA5Q8NB90 893 aa21.85■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 F8W031 263 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 MYO1BO43795 1136 aa21.84■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 RASGRF1Q13972 1273 aa21.84■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.84■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.83■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 ERC2O15083 957 aa21.83■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 EPS15P42566 896 aa21.83■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.83■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 ABCF2Q9UG63 623 aa21.83■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
BRF1-209ENST00000547052 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.82■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 LDHDQ86WU2 507 aa21.82■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 SMC5Q8IY18 1101 aa21.82■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.82■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 DOCK2Q92608 1830 aa21.82■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 IGSF3O75054 1194 aa21.81■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 DLGAP5Q15398 846 aa21.81■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.81■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 TEKT1Q969V4 418 aa21.81■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.81■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 GMLQ99445 158 aa21.81■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 MXD3Q9BW11 206 aa21.81■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.81■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.81■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 TOMM70O94826 608 aa21.8■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 MCAMP43121 646 aa21.8■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 GSTO1P78417 241 aa21.8■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.8■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.8■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.8■■□□□ 1.08
BRF1-209ENST00000547052 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms