RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 ADM5C9JUS6 153 aa23.01■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 GYG1P46976 350 aa23.01■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.01■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.01■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 CAPNS2Q96L46 248 aa23.01■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 NBPF9Q3BBW0 867 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 VPS37DQ86XT2 251 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 CERS5Q8N5B7 392 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 C2orf69Q8N8R5 385 aa23■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 FGFR2P21802 821 aa22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 MTX1Q13505 466 aa22.99■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 FKBP1BP68106 108 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 LPIN2Q92539 896 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 CDCA5Q96FF9 252 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 COPRSQ9NQ92 184 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC5A1P13866 664 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 MAP2K2P36507 400 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 DLGAP5Q15398 846 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 WBP1LQ9NX94 342 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 HUNKP57058 714 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 AIDAQ96BJ3 306 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-216ENST00000526055 GNAI2P04899 355 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 DLK2Q6UY11 383 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 MYO1BO43795 1136 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 SRGAP3O43295 1099 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 CFAP100Q494V2 611 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 SIL1Q9H173 461 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 TNNQ9UQP3 1299 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 F8W031 263 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 ZBTB22O15209 634 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 SPDYE6P0CI01 402 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 NF2P35240 595 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 BCAMP50895 628 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 NOGQ13253 232 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 RGMBQ6NW40 437 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 JAG2Q9Y219 1238 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 ATP2B3Q16720 1220 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC102AQ96A19 550 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 GRM1Q13255 1194 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 MRIQ9BWK5 157 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-216ENST00000526055 FOXN1O15353 648 aa22.89■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.89■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 MAST3O60307 1309 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 SEMA3EO15041 775 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 CA12O43570 354 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 AOC2O75106 756 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 MS4A1P11836 297 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 TNS4Q8IZW8 715 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 TNFAIP1Q13829 316 aa22.86■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.86■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 CRKP46108 304 aa22.85■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.85■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.85■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC10A3P09131 477 aa22.84■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 RLBP1P12271 317 aa22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms