RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522926.1

TNIP1-216, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNIP1, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1-216ENST00000522926 F8W031 263 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TNIP1-216ENST00000522926 TAF5LO75529 589 aa23.48■■□□□ 1.35
TNIP1-216ENST00000522926 ALDH1A1P00352 501 aa23.48■■□□□ 1.35
TNIP1-216ENST00000522926 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.48■■□□□ 1.35
TNIP1-216ENST00000522926 STK31Q9BXU1 1019 aa23.48■■□□□ 1.35
TNIP1-216ENST00000522926 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TNIP1-216ENST00000522926 SLC4A2P04920 1241 aa23.47■■□□□ 1.35
TNIP1-216ENST00000522926 KCNJ4P48050 445 aa23.47■■□□□ 1.35
TNIP1-216ENST00000522926 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.47■■□□□ 1.35
TNIP1-216ENST00000522926 JAG2Q9Y219 1238 aa23.47■■□□□ 1.35
TNIP1-216ENST00000522926 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TNIP1-216ENST00000522926 CFAP100Q494V2 611 aa23.46■■□□□ 1.35
TNIP1-216ENST00000522926 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TNIP1-216ENST00000522926 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TNIP1-216ENST00000522926 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.46■■□□□ 1.35
TNIP1-216ENST00000522926 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.45■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 SPDYE6P0CI01 402 aa23.45■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 INHBEP58166 350 aa23.45■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.45■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 PTPN18Q99952 460 aa23.45■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 FLIIQ13045 1269 aa23.44■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 CRHR2Q13324 411 aa23.44■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 VEZTQ9HBM0 779 aa23.43■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.43■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 IL1R1P14778 569 aa23.42■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 FOXO4P98177 505 aa23.42■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.42■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 LAMB1P07942 1786 aa23.42■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.41■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.41■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.41■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 A0A1B0GUL6 1792 aa23.4■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 EN2P19622 333 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 RASA3Q14644 834 aa23.4■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 CCDC184Q52MB2 194 aa23.4■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 LINS1Q8NG48 757 aa23.4■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.4■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 SZT2Q5T011 3432 aa23.39■■□□□ 1.34
TNIP1-216ENST00000522926 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.39■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 WWC1Q8IX03 1113 aa23.39■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 ARMC5Q96C12 935 aa23.39■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 GCC1Q96CN9 775 aa23.39■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 ERO1AQ96HE7 468 aa23.39■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.39■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.38■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.38■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 ELP3Q9H9T3 547 aa23.38■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 UNCXA6NJT0 531 aa23.37■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 MYO1BO43795 1136 aa23.37■■□□□ 1.33
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TNIP1-216ENST00000522926 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.37■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.37■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 EFCC1Q9HA90 598 aa23.37■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 OTOFQ9HC10 1997 aa23.36■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 SP3Q02447 781 aa23.36■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.36■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 OPTNQ96CV9 577 aa23.36■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.36■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 F6X3S4 739 aa23.35■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 PLIN1O60240 522 aa23.35■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 CCDC27Q2M243 656 aa23.35■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 TEPSINQ96N21 525 aa23.35■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.34■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.34■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.34■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 CEP290O15078 2479 aa23.34■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 BEND3Q5T5X7 828 aa23.33■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.33■■□□□ 1.33
TNIP1-216ENST00000522926 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.33■■□□□ 1.32
TNIP1-216ENST00000522926 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.33■■□□□ 1.32
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF333Q96JL9 665 aa23.32■■□□□ 1.32
TNIP1-216ENST00000522926 VAMP4O75379 141 aa23.31■■□□□ 1.32
TNIP1-216ENST00000522926 GYG1P46976 350 aa23.31■■□□□ 1.32
TNIP1-216ENST00000522926 GRIK5Q16478 980 aa23.31■■□□□ 1.32
TNIP1-216ENST00000522926 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.31■■□□□ 1.32
TNIP1-216ENST00000522926 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.31■■□□□ 1.32
TNIP1-216ENST00000522926 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
TNIP1-216ENST00000522926 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.31■■□□□ 1.32
TNIP1-216ENST00000522926 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
TNIP1-216ENST00000522926 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.31■■□□□ 1.32
TNIP1-216ENST00000522926 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
TNIP1-216ENST00000522926 VGLL4Q14135 290 aa23.3■■□□□ 1.32
TNIP1-216ENST00000522926 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.3■■□□□ 1.32
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