RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518885.1

CNOT7-204, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 7, human

TSL 3

Gene CNOT7, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT7-204	ENST00000518885	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		30.11	■■■□□ 2.41
CNOT7-204	ENST00000518885	GNAI2	P04899	355 aa		30.1	■■■□□ 2.41
CNOT7-204	ENST00000518885	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		30.1	■■■□□ 2.41
CNOT7-204	ENST00000518885	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	30.1	■■■□□ 2.41
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	30.1	■■■□□ 2.41
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC5A1	P13866	664 aa		30.09	■■■□□ 2.41
CNOT7-204	ENST00000518885	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	30.09	■■■□□ 2.41
CNOT7-204	ENST00000518885	DLGAP5	Q15398	846 aa		30.09	■■■□□ 2.41
CNOT7-204	ENST00000518885	LPIN2	Q92539	896 aa		30.09	■■■□□ 2.41
CNOT7-204	ENST00000518885	AIDA	Q96BJ3	306 aa		30.09	■■■□□ 2.41
CNOT7-204	ENST00000518885	PCNT	O95613	3336 aa		30.09	■■■□□ 2.41
CNOT7-204	ENST00000518885	WNT10B	O00744	389 aa		30.08	■■■□□ 2.41
CNOT7-204	ENST00000518885	MYO1B	O43795	1136 aa		30.08	■■■□□ 2.41
CNOT7-204	ENST00000518885	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	30.08	■■■□□ 2.41
CNOT7-204	ENST00000518885	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	30.08	■■■□□ 2.41
CNOT7-204	ENST00000518885	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		30.08	■■■□□ 2.41
CNOT7-204	ENST00000518885	CAPNS2	Q96L46	248 aa		30.08	■■■□□ 2.41
CNOT7-204	ENST00000518885	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		30.08	■■■□□ 2.41
CNOT7-204	ENST00000518885	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		30.07	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	30.07	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		30.07	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	SIL1	Q9H173	461 aa		30.07	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	30.07	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	COPRS	Q9NQ92	184 aa		30.07	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	30.06	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	SRGAP3	O43295	1099 aa		30.06	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	30.06	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	MTX1	Q13505	466 aa		30.06	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		30.06	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		30.06	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	CDCA5	Q96FF9	252 aa		30.06	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	HUNK	P57058	714 aa		30.05	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	30.05	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	CERS5	Q8N5B7	392 aa		30.05	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	MS4A1	P11836	297 aa		30.04	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	FGFR2	P21802	821 aa		30.04	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	NF2	P35240	595 aa		30.04	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	FKBP1B	P68106	108 aa		30.04	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	GRM1	Q13255	1194 aa		30.04	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		30.04	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		30.04	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885		F8W031	263 aa	Predicted RBP	30.03	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		30.03	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	30.03	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	JAG2	Q9Y219	1238 aa		30.03	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	MAP2K2	P36507	400 aa		30.02	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	ATP2B3	Q16720	1220 aa		30.02	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		30.02	■■■□□ 2.4
CNOT7-204	ENST00000518885	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	30.01	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	CFAP100	Q494V2	611 aa		30.01	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		30.01	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	30	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	BCAM	P50895	628 aa		30	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		30	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	30	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	30	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	TNN	Q9UQP3	1299 aa		30	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	29.99	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	29.99	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	CCDC102A	Q96A19	550 aa		29.99	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		29.99	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	MAST3	O60307	1309 aa		29.98	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		29.98	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	SPDYE6	P0CI01	402 aa		29.98	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	DLK2	Q6UY11	383 aa		29.98	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	29.98	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	29.98	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		29.98	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		29.98	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	NOG	Q13253	232 aa		29.97	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	RGMB	Q6NW40	437 aa		29.97	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	WBP1L	Q9NX94	342 aa		29.97	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		29.96	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		29.96	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		29.96	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	29.95	■■■□□ 2.39
CNOT7-204	ENST00000518885	SEMA3E	O15041	775 aa		29.94	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	29.94	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	29.94	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	29.94	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	TNFAIP1	Q13829	316 aa		29.94	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		29.93	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	29.93	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	29.92	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		29.92	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	VEZT	Q9HBM0	779 aa		29.92	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	CA12	O43570	354 aa		29.91	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	CRK	P46108	304 aa		29.91	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	TEKT1	Q969V4	418 aa		29.91	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	MRI	Q9BWK5	157 aa		29.91	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		29.91	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		29.9	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		29.9	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	29.9	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	ZBTB22	O15209	634 aa		29.89	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	FOXN1	O15353	648 aa		29.89	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	AOC2	O75106	756 aa		29.89	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	29.89	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		29.89	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	29.89	■■■□□ 2.38

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