RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 F8W031 263 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 SUCLG2Q96I99 432 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 JAG2Q9Y219 1238 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 PRKG1Q13976 671 aa21.39■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 KAZALD1Q96I82 304 aa21.39■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.38■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.37■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.37■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 CFAP100Q494V2 611 aa21.36■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 FZD1Q9UP38 647 aa21.36■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 UTYO14607 1347 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 CLRN2A0PK11 232 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 GYG1P46976 350 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 RGS19P49795 217 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 UBE4AQ14139 1066 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.34■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 MYO1BO43795 1136 aa21.34■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 SPDYE6P0CI01 402 aa21.34■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 TM4SF4P48230 202 aa21.34■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.34■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 AOX1Q06278 1338 aa21.33■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.33■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D8O95759 1140 aa21.33■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 VEZTQ9HBM0 779 aa21.33■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.33■■□□□ 1.01
HERC3-211ENST00000513325 E9PSI1 815 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 PTPRCP08575 1304 aa21.31■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.31■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.31■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.31■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 SREBF2Q12772 1141 aa21.3■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 LRRC24Q50LG9 513 aa21.3■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 SPRYD7Q5W111 196 aa21.3■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.3■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 SLFN5Q08AF3 891 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 MAP3K11Q16584 847 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 RASA3Q14644 834 aa21.28■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 METTL24Q5JXM2 366 aa21.28■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.28■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.28■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 USP44Q9H0E7 712 aa21.28■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 VPS37DQ86XT2 251 aa21.27■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.27■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.27■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
HERC3-211ENST00000513325 GPR25O00155 361 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 PDE8BO95263 885 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 GRIK5Q16478 980 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 WNK4Q96J92 1243 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 CRKP46108 304 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 SOX10P56693 466 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 TNFAIP1Q13829 316 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 UNCXA6NJT0 531 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 INHBEP58166 350 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-211ENST00000513325 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.23■□□□□ 0.99
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