RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 VEZTQ9HBM0 779 aa20.29■□□□□ 0.84
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SH3BP2-215ENST00000510074 SP3Q02447 781 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-215ENST00000510074 CRHR2Q13324 411 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-215ENST00000510074 GCKRQ14397 625 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-215ENST00000510074 CFAP100Q494V2 611 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP2-215ENST00000510074 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.27■□□□□ 0.84
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SH3BP2-215ENST00000510074 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-215ENST00000510074 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.27■□□□□ 0.84
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SH3BP2-215ENST00000510074 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
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SH3BP2-215ENST00000510074 ELP3Q9H9T3 547 aa20.22■□□□□ 0.83
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SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
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SH3BP2-215ENST00000510074 CCL15Q16663 113 aa20.16■□□□□ 0.82
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SH3BP2-215ENST00000510074 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.15■□□□□ 0.82
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SH3BP2-215ENST00000510074 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
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SH3BP2-215ENST00000510074 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
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