RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509638.5

LIMCH1-211, Transcript of LIM and calponin homology domains 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMCH1, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMCH1-211ENST00000509638 USP17L1Q7RTZ2 530 aa36.26■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 SEMA3EO15041 775 aa36.25■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa36.24■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 TNIP1Q15025 636 aa36.24■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 SCARF1Q14162 830 aa36.23■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 STRIP1Q5VSL9 837 aa36.23■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 TTLL5Q6EMB2 1281 aa36.23■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 GJA3Q9Y6H8 435 aa36.23■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM205AQ6ZU69 1335 aa36.23■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 MCAMP43121 646 aa36.23■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 GPATCH3Q96I76 525 aa36.23■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 DENND2AQ9ULE3 1009 aa36.23■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 DACT2Q5SW24 774 aa36.22■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 PI16Q6UXB8 463 aa36.22■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 GPC2Q8N158 579 aa36.22■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 SALL3Q9BXA9 1300 aa36.21■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 ZBTB22O15209 634 aa36.21■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 TSHZ3Q63HK5 1081 aa36.21■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 MX1P20591 662 aa36.2■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 MXD3Q9BW11 206 aa36.2■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 ECHDC1Q9NTX5 307 aa36.2■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 HMG20BQ9P0W2 317 aa36.2■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
LIMCH1-211ENST00000509638 DDNO94850 711 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 VIL1P09327 827 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 DPY19L2Q6NUT2 758 aa36.19■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 SPATA5Q8NB90 893 aa36.19■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 GLTPD2A6NH11 291 aa36.18■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 MFSD14BQ5SR56 506 aa36.18■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 SNRKQ9NRH2 765 aa36.17■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 WDR90Q96KV7 1748 aa36.16■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 CERS5Q8N5B7 392 aa36.16■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 TTC41PQ6P2S7 1318 aa36.16■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 ATP5JP18859 108 aa36.15■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 WDR66Q8TBY9 1149 aa36.15■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa36.15■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 MYO3BQ8WXR4 1341 aa36.15■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP36.15■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa36.15■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 DOCK2Q92608 1830 aa36.14■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 PDE4AP27815 886 aa36.14■■■■□ 3.38
LIMCH1-211ENST00000509638 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 MAST2Q6P0Q8 1798 aa36.12■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 SALL1Q9NSC2 1324 aa36.12■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 RPS12P25398 132 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 ZAP70P43403 619 aa36.12■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 PDE1AP54750 535 aa36.12■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 BOLA2Q9H3K6 86 aa36.12■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 SCN4AP35499 1836 aa36.12■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 AGBL3Q8NEM8 1001 aa36.11■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 PI4K2BQ8TCG2 481 aa36.11■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 STAP2Q9UGK3 403 aa36.11■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 SCNN1DP51172 638 aa36.1■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 GMLQ99445 158 aa36.1■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa36.1■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 ERC2O15083 957 aa36.1■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa36.1■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 KIAA0825Q8IV33 1275 aa36.09■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 HAUS7Q99871 368 aa36.09■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 GRIK5Q16478 980 aa36.08■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 ABCF2Q9UG63 623 aa36.08■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 PRDX5P30044 214 aa36.07■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa36.07■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 DPF2Q92785 391 aa36.07■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa36.07■■■■□ 3.37
LIMCH1-211ENST00000509638 AOX1Q06278 1338 aa36.07■■■■□ 3.36
LIMCH1-211ENST00000509638 F8W031 263 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
LIMCH1-211ENST00000509638 YY1P25490 414 aa36.06■■■■□ 3.36
LIMCH1-211ENST00000509638 GPRC5DQ9NZD1 345 aa36.06■■■■□ 3.36
LIMCH1-211ENST00000509638 SKAP1Q86WV1 359 aa36.06■■■■□ 3.36
LIMCH1-211ENST00000509638 MYH7P12883 1935 aa36.05■■■■□ 3.36
LIMCH1-211ENST00000509638 SHTN1A0MZ66 631 aa36.05■■■■□ 3.36
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LIMCH1-211ENST00000509638 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
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LIMCH1-211ENST00000509638 USP17L8P0C7I0 530 aa36.04■■■■□ 3.36
LIMCH1-211ENST00000509638 ANTXR1Q9H6X2 564 aa36.04■■■■□ 3.36
LIMCH1-211ENST00000509638 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
LIMCH1-211ENST00000509638 PAG1Q9NWQ8 432 aa36.04■■■■□ 3.36
LIMCH1-211ENST00000509638 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa36.04■■■■□ 3.36
LIMCH1-211ENST00000509638 LDHBP07195 334 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
LIMCH1-211ENST00000509638 OSBPL3Q9H4L5 887 aa36.03■■■■□ 3.36
LIMCH1-211ENST00000509638 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
LIMCH1-211ENST00000509638 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
LIMCH1-211ENST00000509638 AK9Q5TCS8 1911 aa36.02■■■■□ 3.36
LIMCH1-211ENST00000509638 MYH2Q9UKX2 1941 aa36.02■■■■□ 3.36
LIMCH1-211ENST00000509638 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
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