RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493607.1

SERBP1-208, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene SERBP1, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERBP1-208	ENST00000493607	ADM5	C9JUS6	153 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	CERS5	Q8N5B7	392 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	FGFR2	P21802	821 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	MTX1	Q13505	466 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	CAPNS2	Q96L46	248 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	GYG1	P46976	350 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	COPRS	Q9NQ92	184 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	MAP2K2	P36507	400 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	CDCA5	Q96FF9	252 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	WBP1L	Q9NX94	342 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	FKBP1B	P68106	108 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	DLK2	Q6UY11	383 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	VPS37D	Q86XT2	251 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	LPIN2	Q92539	896 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	ZBTB22	O15209	634 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	DLGAP5	Q15398	846 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	HUNK	P57058	714 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	SLC5A1	P13866	664 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	TNN	Q9UQP3	1299 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	GNAI2	P04899	355 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SERBP1-208	ENST00000493607	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	SPDYE6	P0CI01	402 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	AIDA	Q96BJ3	306 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	NOG	Q13253	232 aa		29	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	CFAP100	Q494V2	611 aa		29	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	RGMB	Q6NW40	437 aa		29	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		29	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		29	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	SRGAP3	O43295	1099 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	MYO1B	O43795	1136 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	BCAM	P50895	628 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	CCDC102A	Q96A19	550 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	SIL1	Q9H173	461 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	JAG2	Q9Y219	1238 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	FOXN1	O15353	648 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	MRI	Q9BWK5	157 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607		F8W031	263 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	ATP2B3	Q16720	1220 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	NF2	P35240	595 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
SERBP1-208	ENST00000493607	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	SEMA3E	O15041	775 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	AOC2	O75106	756 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	CA12	O43570	354 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	GRM1	Q13255	1194 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	MAST3	O60307	1309 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	SLC10A3	P09131	477 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	CRK	P46108	304 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	28.91	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	IFFO2	Q5TF58	517 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	MS4A1	P11836	297 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	TNFAIP1	Q13829	316 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22

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