RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 FOXN1O15353 648 aa29.59■■■□□ 2.33
CTDSP1-211ENST00000492545 FKBP1BP68106 108 aa29.59■■■□□ 2.33
CTDSP1-211ENST00000492545 GRM1Q13255 1194 aa29.59■■■□□ 2.33
CTDSP1-211ENST00000492545 CAVIN4Q5BKX8 364 aa29.59■■■□□ 2.33
CTDSP1-211ENST00000492545 CERS5Q8N5B7 392 aa29.59■■■□□ 2.33
CTDSP1-211ENST00000492545 VGLL2Q8N8G2 317 aa29.59■■■□□ 2.33
CTDSP1-211ENST00000492545 BEGAINQ9BUH8 593 aa29.59■■■□□ 2.33
CTDSP1-211ENST00000492545 A0A1B0GUL6 1792 aa29.59■■■□□ 2.33
CTDSP1-211ENST00000492545 EYA2O00167 538 aa29.58■■■□□ 2.33
CTDSP1-211ENST00000492545 GYG1P46976 350 aa29.58■■■□□ 2.33
CTDSP1-211ENST00000492545 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
CTDSP1-211ENST00000492545 FBXO33Q7Z6M2 555 aa29.58■■■□□ 2.33
CTDSP1-211ENST00000492545 VPS37DQ86XT2 251 aa29.58■■■□□ 2.33
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
CTDSP1-211ENST00000492545 GNAI3P08754 354 aa29.57■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 NOGQ13253 232 aa29.57■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 DLGAP5Q15398 846 aa29.57■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 KLHDC4Q8TBB5 520 aa29.57■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC102AQ96A19 550 aa29.57■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 PRDM10Q9NQV6 1147 aa29.57■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 RGMBQ6NW40 437 aa29.56■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 CIAO1O76071 339 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 MYO1BO43795 1136 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 AOC2O75106 756 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 MFSD14BQ5SR56 506 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 CA12O43570 354 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 BCAR3O75815 825 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIM27P14373 513 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 NF2P35240 595 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 MEIS3Q99687 375 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 THSD7BQ9C0I4 1608 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDSP1-211ENST00000492545 FGFR2P21802 821 aa29.51■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa29.51■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 LPIN2Q92539 896 aa29.51■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 F8W031 263 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 CFAP100Q494V2 611 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 JAG2Q9Y219 1238 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 SPDYE2BA6NHP3 402 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 SPDYE6P0CI01 402 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC5A1P13866 664 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 TNS4Q8IZW8 715 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 COPRSQ9NQ92 184 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 CEP126Q9P2H0 1117 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 SERPINA10Q9UK55 444 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 IL15P40933 162 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 LBX1P52954 281 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 BCAMP50895 628 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP29.46■■■□□ 2.316e-7■□□□□ 10.3
CTDSP1-211ENST00000492545 MTX1Q13505 466 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 DEFB129Q9H1M3 183 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 SIL1Q9H173 461 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDSP1-211ENST00000492545 GNAI2P04899 355 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC10A3P09131 477 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 MRIQ9BWK5 157 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 SRGAP3O43295 1099 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP2B3Q16720 1220 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 ARMC9Q7Z3E5 817 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 TNFAIP1Q13829 316 aa29.41■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa29.41■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBTB22O15209 634 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 WDR66Q8TBY9 1149 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 CLRN2A0PK11 232 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 UBE2Q2LH0YL09 131 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 CRKP46108 304 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 ZIC5Q96T25 663 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
CTDSP1-211ENST00000492545 MAST3O60307 1309 aa29.39■■■□□ 2.3
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