RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa35.03■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 BEGAINQ9BUH8 593 aa35.03■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC24Q50LG9 513 aa35.02■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 VGLL2Q8N8G2 317 aa35.02■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 HDAC9Q9UKV0 1011 aa35.02■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 CAPN15O75808 1086 aa35.01■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 SLC10A3P09131 477 aa35.01■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 FKBP1BP68106 108 aa35.01■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 MTMR14Q8NCE2 650 aa35.01■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC102AQ96A19 550 aa35.01■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa35.01■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 FAM205AQ6ZU69 1335 aa35.01■■■■□ 3.19
HOXB3-211ENST00000490677 MOB2Q70IA6 237 aa35■■■■□ 3.19
HOXB3-211ENST00000490677 KLHDC4Q8TBB5 520 aa35■■■■□ 3.19
HOXB3-211ENST00000490677 JAG2Q9Y219 1238 aa35■■■■□ 3.19
HOXB3-211ENST00000490677 MROH5Q6ZUA9 1318 aa35■■■■□ 3.19
HOXB3-211ENST00000490677 MYH13Q9UKX3 1938 aa34.99■■■■□ 3.19
HOXB3-211ENST00000490677 GYG1P46976 350 aa34.99■■■■□ 3.19
HOXB3-211ENST00000490677 CA12O43570 354 aa34.98■■■■□ 3.19
HOXB3-211ENST00000490677 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
HOXB3-211ENST00000490677 RASAL3Q86YV0 1011 aa34.97■■■■□ 3.19
HOXB3-211ENST00000490677 AOX1Q06278 1338 aa34.97■■■■□ 3.19
HOXB3-211ENST00000490677 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
HOXB3-211ENST00000490677 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
HOXB3-211ENST00000490677 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
HOXB3-211ENST00000490677 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
HOXB3-211ENST00000490677 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
HOXB3-211ENST00000490677 F8W031 263 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
HOXB3-211ENST00000490677 FBXO33Q7Z6M2 555 aa34.94■■■■□ 3.18
HOXB3-211ENST00000490677 LAMB1P07942 1786 aa34.94■■■■□ 3.18
HOXB3-211ENST00000490677 RARSP54136 660 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
HOXB3-211ENST00000490677 DLGAP5Q15398 846 aa34.93■■■■□ 3.18
HOXB3-211ENST00000490677 SSC5DA1L4H1 1573 aa34.92■■■■□ 3.18
HOXB3-211ENST00000490677 SPDYE2BA6NHP3 402 aa34.92■■■■□ 3.18
HOXB3-211ENST00000490677 UBE2Q2LH0YL09 131 aa34.92■■■■□ 3.18
HOXB3-211ENST00000490677 PDE8BO95263 885 aa34.92■■■■□ 3.18
HOXB3-211ENST00000490677 SPDYE6P0CI01 402 aa34.92■■■■□ 3.18
HOXB3-211ENST00000490677 CFAP100Q494V2 611 aa34.92■■■■□ 3.18
HOXB3-211ENST00000490677 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
HOXB3-211ENST00000490677 METTL24Q5JXM2 366 aa34.91■■■■□ 3.18
HOXB3-211ENST00000490677 CSRNP1Q96S65 589 aa34.91■■■■□ 3.18
HOXB3-211ENST00000490677 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
HOXB3-211ENST00000490677 FGFR2P21802 821 aa34.89■■■■□ 3.18
HOXB3-211ENST00000490677 MFSD14BQ5SR56 506 aa34.89■■■■□ 3.18
HOXB3-211ENST00000490677 DEFB129Q9H1M3 183 aa34.88■■■■□ 3.17
HOXB3-211ENST00000490677 GRIK5Q16478 980 aa34.87■■■■□ 3.17
HOXB3-211ENST00000490677 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
HOXB3-211ENST00000490677 SAGE1Q9NXZ1 904 aa34.87■■■■□ 3.17
HOXB3-211ENST00000490677 OTOFQ9HC10 1997 aa34.86■■■■□ 3.17
HOXB3-211ENST00000490677 EYA2O00167 538 aa34.86■■■■□ 3.17
HOXB3-211ENST00000490677 ATG9AQ7Z3C6 839 aa34.86■■■■□ 3.17
HOXB3-211ENST00000490677 CLRN2A0PK11 232 aa34.85■■■■□ 3.17
HOXB3-211ENST00000490677 RNF186Q9NXI6 227 aa34.85■■■■□ 3.17
HOXB3-211ENST00000490677 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
HOXB3-211ENST00000490677 KIF16BQ96L93 1317 aa34.84■■■■□ 3.17
HOXB3-211ENST00000490677 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
HOXB3-211ENST00000490677 NF2P35240 595 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXB3-211ENST00000490677 LDLRAD1Q5T700 205 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXB3-211ENST00000490677 ARHGAP45Q92619 1136 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXB3-211ENST00000490677 ABHD8Q96I13 439 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXB3-211ENST00000490677 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
HOXB3-211ENST00000490677 FZD1Q9UP38 647 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXB3-211ENST00000490677 BCAMP50895 628 aa34.82■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 SERPINA10Q9UK55 444 aa34.82■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa34.82■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 MIER1Q8N108 512 aa34.81■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 MEIS3Q99687 375 aa34.81■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 TRPA1O75762 1119 aa34.8■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 PRKG1Q13976 671 aa34.8■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 MYO1BO43795 1136 aa34.79■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 MAP3K11Q16584 847 aa34.79■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 SPDYE2Q495Y8 402 aa34.79■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 CAVIN4Q5BKX8 364 aa34.79■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 ARMC9Q7Z3E5 817 aa34.78■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 VPS37DQ86XT2 251 aa34.78■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP34.77■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 VEZTQ9HBM0 779 aa34.77■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 FBXO3Q9UK99 471 aa34.77■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 CIAO1O76071 339 aa34.76■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 CRKP46108 304 aa34.76■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 TNNQ9UQP3 1299 aa34.76■■■■□ 3.16
HOXB3-211ENST00000490677 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 RASA3Q14644 834 aa34.75■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa34.75■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 LPIN2Q92539 896 aa34.75■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 SIL1Q9H173 461 aa34.74■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms