RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489692.1

GGPS1-207, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene GGPS1, Length 506 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-207ENST00000489692 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
GGPS1-207ENST00000489692 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GGPS1-207ENST00000489692 NOGQ13253 232 aa14.66□□□□□ -0.06
GGPS1-207ENST00000489692 DLGAP5Q15398 846 aa14.66□□□□□ -0.06
GGPS1-207ENST00000489692 METTL24Q5JXM2 366 aa14.66□□□□□ -0.06
GGPS1-207ENST00000489692 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.66□□□□□ -0.06
GGPS1-207ENST00000489692 WNT10BO00744 389 aa14.65□□□□□ -0.06
GGPS1-207ENST00000489692 BCAR3O75815 825 aa14.65□□□□□ -0.06
GGPS1-207ENST00000489692 CCDC102AQ96A19 550 aa14.65□□□□□ -0.06
GGPS1-207ENST00000489692 KAZALD1Q96I82 304 aa14.65□□□□□ -0.06
GGPS1-207ENST00000489692 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GGPS1-207ENST00000489692 ZNF609O15014 1411 aa14.65□□□□□ -0.06
GGPS1-207ENST00000489692 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.65□□□□□ -0.06
GGPS1-207ENST00000489692 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.65□□□□□ -0.06
GGPS1-207ENST00000489692 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 GYG1P46976 350 aa14.64□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 MMP14P50281 582 aa14.64□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 UBE4AQ14139 1066 aa14.64□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 UTYO14607 1347 aa14.64□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 MYO1BO43795 1136 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 IL1R1P14778 569 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 PRKG1Q13976 671 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 LRRC24Q50LG9 513 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 USP44Q9H0E7 712 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 CA12O43570 354 aa14.62□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 CERS5Q8N5B7 392 aa14.62□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 VEZTQ9HBM0 779 aa14.62□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.61□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 FKBP1BP68106 108 aa14.61□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 CFAP100Q494V2 611 aa14.61□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.61□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 MOB2Q70IA6 237 aa14.61□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 ZIC5Q96T25 663 aa14.61□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.61□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.61□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.61□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 CLRN2A0PK11 232 aa14.6□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 SIL1Q9H173 461 aa14.6□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 SCN9AQ15858 1988 aa14.6□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 PDE8BO95263 885 aa14.59□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 SLC10A3P09131 477 aa14.59□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.59□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.59□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 KIF16BQ96L93 1317 aa14.59□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 SPEF2Q9C093 1822 aa14.59□□□□□ -0.07
GGPS1-207ENST00000489692 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.58□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 MYH3P11055 1940 aa14.58□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 EYA2O00167 538 aa14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 TRPA1O75762 1119 aa14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 SPDYE6P0CI01 402 aa14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 SLC5A1P13866 664 aa14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 BCAMP50895 628 aa14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.56□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.56□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.56□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.55□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 TNFAIP1Q13829 316 aa14.55□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.55□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.55□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.55□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 CSRNP1Q96S65 589 aa14.55□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 MEIS3Q99687 375 aa14.55□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.55□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 CACNA1FO60840 1977 aa14.54□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 GNAI3P08754 354 aa14.54□□□□□ -0.08
GGPS1-207ENST00000489692 CRKP46108 304 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.3 ms