RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488865.2

RNF220-216, Transcript of ring finger protein 220, human

TSL 2

Gene RNF220, Length 860 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF220-216	ENST00000488865	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		32.87	■■■□□ 2.85
RNF220-216	ENST00000488865	DLGAP5	Q15398	846 aa		32.85	■■■□□ 2.85
RNF220-216	ENST00000488865	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
RNF220-216	ENST00000488865	UTY	O14607	1347 aa		32.83	■■■□□ 2.85
RNF220-216	ENST00000488865	PLIN1	O60240	522 aa		32.83	■■■□□ 2.85
RNF220-216	ENST00000488865	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		32.83	■■■□□ 2.85
RNF220-216	ENST00000488865	RGS19	P49795	217 aa		32.82	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865	KAZALD1	Q96I82	304 aa		32.82	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865	SUCLG2	Q96I99	432 aa		32.82	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865	UBE4A	Q14139	1066 aa		32.81	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		32.78	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865		F8W031	263 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865	MYO1B	O43795	1136 aa		32.78	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865	TM4SF4	P48230	202 aa		32.78	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865	CFAP100	Q494V2	611 aa		32.78	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		32.78	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		32.78	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865	PTPRC	P08575	1304 aa		32.77	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		32.77	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865	SPDYE6	P0CI01	402 aa		32.77	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		32.77	■■■□□ 2.84
RNF220-216	ENST00000488865		E9PSI1	815 aa		32.76	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		32.76	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		32.76	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	PRKG1	Q13976	671 aa		32.75	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	JAG2	Q9Y219	1238 aa		32.75	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		32.75	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	SREBF2	Q12772	1141 aa		32.73	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	MAP3K11	Q16584	847 aa		32.73	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	GYG1	P46976	350 aa		32.72	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	CLRN2	A0PK11	232 aa		32.71	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		32.71	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	32.7	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	SPRYD7	Q5W111	196 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RNF220-216	ENST00000488865	SLFN5	Q08AF3	891 aa		32.69	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	VEZT	Q9HBM0	779 aa		32.69	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		32.69	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	UNCX	A6NJT0	531 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	TBC1D8	O95759	1140 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	FZD1	Q9UP38	647 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	AOX1	Q06278	1338 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	LRRC24	Q50LG9	513 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	USP44	Q9H0E7	712 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	RASA3	Q14644	834 aa		32.65	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		32.65	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	METTL24	Q5JXM2	366 aa		32.65	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	VPS37D	Q86XT2	251 aa		32.65	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		32.65	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	PDE8B	O95263	885 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	INHBE	P58166	350 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	TNFAIP1	Q13829	316 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RNF220-216	ENST00000488865	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
RNF220-216	ENST00000488865	GPR25	O00155	361 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RNF220-216	ENST00000488865	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
RNF220-216	ENST00000488865	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RNF220-216	ENST00000488865	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
RNF220-216	ENST00000488865	ALDH1A1	P00352	501 aa		32.62	■■■□□ 2.81
RNF220-216	ENST00000488865	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
RNF220-216	ENST00000488865	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
RNF220-216	ENST00000488865	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RNF220-216	ENST00000488865	WNK4	Q96J92	1243 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RNF220-216	ENST00000488865	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RNF220-216	ENST00000488865	CRK	P46108	304 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RNF220-216	ENST00000488865	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
RNF220-216	ENST00000488865	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
RNF220-216	ENST00000488865	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
RNF220-216	ENST00000488865	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
RNF220-216	ENST00000488865	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		32.58	■■■□□ 2.81
RNF220-216	ENST00000488865	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		32.58	■■■□□ 2.81
RNF220-216	ENST00000488865	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81

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