RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487849.7

HOXB-AS3-212, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 428 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RLBP1P12271 317 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-212ENST00000487849 F8W031 263 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ATP2B3Q16720 1220 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FGFR2P21802 821 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PANK1Q8TE04 598 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BCAMP50895 628 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DLGAP5Q15398 846 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CERS5Q8N5B7 392 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CNTNAP1P78357 1384 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ADM5C9JUS6 153 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DEFB115Q30KQ5 88 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CST9Q5W186 159 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 WNT10BO00744 389 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RASSF10A6NK89 507 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MYO1BO43795 1136 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 JMYQ8N9B5 988 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PCNTO95613 3336 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ATP8B2P98198 1209 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CFAP100Q494V2 611 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TLL2Q9Y6L7 1015 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TFCP2Q12800 502 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ECE1P42892 770 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 VEGFBP49765 207 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DLK2Q6UY11 383 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CDCA5Q96FF9 252 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GRM1Q13255 1194 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SAPCD2Q86UD0 394 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SSH3Q8TE77 659 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 A0A1B0GUL7 405 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SPDYE6P0CI01 402 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 POLA2Q14181 598 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GORABQ5T7V8 394 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 COG6Q9Y2V7 657 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MAST3O60307 1309 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SEMA3EO15041 775 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NF2P35240 595 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HUNKP57058 714 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TIMM10P62072 90 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ADORA1P30542 326 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HHIPL1Q96JK4 782 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CAPNS2Q96L46 248 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PHKA1P46020 1223 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PDE3AQ14432 1141 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCDC102BQ68D86 513 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CEP85Q6P2H3 762 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TEKT1Q969V4 418 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 XAGE2Q96GT9 111 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 VEZTQ9HBM0 779 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CLRN2A0PK11 232 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CRKP46108 304 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CYP4F22Q6NT55 531 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms