RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, human

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRN-215	ENST00000484986	MYO1B	O43795	1136 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PTPRN-215	ENST00000484986	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PTPRN-215	ENST00000484986	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PTPRN-215	ENST00000484986	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
PTPRN-215	ENST00000484986	CERS5	Q8N5B7	392 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PTPRN-215	ENST00000484986	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PTPRN-215	ENST00000484986	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PTPRN-215	ENST00000484986	TM4SF4	P48230	202 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PTPRN-215	ENST00000484986	SREBF2	Q12772	1141 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PTPRN-215	ENST00000484986	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PTPRN-215	ENST00000484986	PLIN1	O60240	522 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PTPRN-215	ENST00000484986	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986		F8W031	263 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	PRKG1	Q13976	671 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	UBE4A	Q14139	1066 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	CFAP100	Q494V2	611 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	SPDYE6	P0CI01	402 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	UNCX	A6NJT0	531 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	TBC1D8	O95759	1140 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	UTY	O14607	1347 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	ZNF521	Q96K83	1311 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	27.9	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	MAP3K11	Q16584	847 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	SPRYD7	Q5W111	196 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	SUCLG2	Q96I99	432 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	INHBE	P58166	350 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	JAG2	Q9Y219	1238 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRN-215	ENST00000484986	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	CLRN2	A0PK11	232 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	ALDH1A1	P00352	501 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	KAZALD1	Q96I82	304 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	VEZT	Q9HBM0	779 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	PTPRC	P08575	1304 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	GPR25	O00155	361 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	GYG1	P46976	350 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	TNFAIP1	Q13829	316 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986		A0A1B0GUL6	1792 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986		E9PSI1	815 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	VPS37D	Q86XT2	251 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	RASA3	Q14644	834 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	FZD1	Q9UP38	647 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRN-215	ENST00000484986	FKTN	O75072	461 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	SOX10	P56693	466 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	METTL24	Q5JXM2	366 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	WNK4	Q96J92	1243 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	IFNL1	Q8IU54	200 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	AOX1	Q06278	1338 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	PDE8B	O95263	885 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	TNNI2	P48788	182 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	CRK	P46108	304 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PTPRN-215	ENST00000484986	LRRC24	Q50LG9	513 aa		27.77	■■■□□ 2.04

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