RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484147.5

PTPN22-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, human

TSL 2

Gene PTPN22, Length 2,258 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN22-205	ENST00000484147	E2F4	Q16254	413 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	PKDCC	Q504Y2	493 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	PHC3	Q8NDX5	983 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	TBC1D12	O60347	775 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	IGHD	P01880	384 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	PSMD2	Q13200	908 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	NUDC	Q9Y266	331 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	PIK3R4	Q99570	1358 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	BMP8B	P34820	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	MAGEA9	P43362	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	SRL	Q86TD4	932 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	KCNB2	Q92953	911 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	LRCH3	Q96II8	777 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	KIF2C	Q99661	725 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	SH3GL3	Q99963	347 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	CP	P00450	1065 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	FLT3	P36888	993 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	CCR10	P46092	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	TRPC1	P48995	793 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	COL15A1	P39059	1388 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	CDKL5	O76039	1030 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	ICA1	Q05084	483 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	PEAK1	Q9H792	1746 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	C2orf72	A6NCS6	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SLC27A2	O14975	620 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TIMM44	O43615	452 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	NAT2	P11245	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	MCM6	Q14566	821 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	C17orf50	Q8WW18	174 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	CAPNS2	Q96L46	248 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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