RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 JAG2Q9Y219 1238 aa29.99■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 FAM205AQ6ZU69 1335 aa29.98■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 EYA2O00167 538 aa29.98■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 ECE1P42892 770 aa29.98■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 FBXO33Q7Z6M2 555 aa29.98■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29.97■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 HDAC9Q9UKV0 1011 aa29.97■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 FGFR2P21802 821 aa29.96■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 FOXN1O15353 648 aa29.95■■■□□ 2.39
PTPRD-210ENST00000481079 ARAP2Q8WZ64 1704 aa29.94■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 HUNKP57058 714 aa29.94■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 GRM1Q13255 1194 aa29.94■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 MTMR14Q8NCE2 650 aa29.94■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 AOC2O75106 756 aa29.93■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 HDAC5Q9UQL6 1122 aa29.93■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa29.93■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 F8W031 263 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 C2orf69Q8N8R5 385 aa29.92■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 FBXO3Q9UK99 471 aa29.92■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 CIAO1O76071 339 aa29.91■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 GNAI3P08754 354 aa29.91■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.91■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 ECM29Q5VYK3 1845 aa29.91■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 MAP2K2P36507 400 aa29.9■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 DLGAP5Q15398 846 aa29.9■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 MFSD14BQ5SR56 506 aa29.9■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 SIL1Q9H173 461 aa29.9■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 BCAMP50895 628 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 MTX1Q13505 466 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 CAVIN4Q5BKX8 364 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 COPRSQ9NQ92 184 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPRD-210ENST00000481079 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 CFAP100Q494V2 611 aa29.88■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 VPS37DQ86XT2 251 aa29.88■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 AOX1Q06278 1338 aa29.88■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 SPDYE2BA6NHP3 402 aa29.87■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 SPDYE6P0CI01 402 aa29.87■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 RGMBQ6NW40 437 aa29.87■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM57Q8N5G2 664 aa29.87■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 LPIN2Q92539 896 aa29.87■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 AIDAQ96BJ3 306 aa29.87■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 GRIK5Q16478 980 aa29.86■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 IFFO2Q5TF58 517 aa29.86■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 ZIC5Q96T25 663 aa29.86■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 FKBP1BP68106 108 aa29.85■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 SLC5A1P13866 664 aa29.84■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 IL15P40933 162 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 SRGAP3O43295 1099 aa29.83■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 NOGQ13253 232 aa29.83■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 MOB2Q70IA6 237 aa29.83■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 CEP126Q9P2H0 1117 aa29.83■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 SERPINA10Q9UK55 444 aa29.83■■■□□ 2.37
PTPRD-210ENST00000481079 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 GNAI2P04899 355 aa29.81■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 ATP2B3Q16720 1220 aa29.81■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa29.81■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 DEFB129Q9H1M3 183 aa29.81■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 PRDM10Q9NQV6 1147 aa29.81■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 CLRN2A0PK11 232 aa29.8■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 SLC10A3P09131 477 aa29.8■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 RLBP1P12271 317 aa29.8■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 CCDC102AQ96A19 550 aa29.8■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 MYH13Q9UKX3 1938 aa29.8■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP29.79■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 LBX1P52954 281 aa29.79■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa29.78■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 MYO1BO43795 1136 aa29.78■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 SSC5DA1L4H1 1573 aa29.77■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 UBE2Q2LH0YL09 131 aa29.77■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 CRKP46108 304 aa29.77■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 SPDYE2Q495Y8 402 aa29.77■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 RASAL3Q86YV0 1011 aa29.77■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
PTPRD-210ENST00000481079 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa29.76■■■□□ 2.35
PTPRD-210ENST00000481079 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
PTPRD-210ENST00000481079 NF2P35240 595 aa29.75■■■□□ 2.35
PTPRD-210ENST00000481079 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
PTPRD-210ENST00000481079 BEGAINQ9BUH8 593 aa29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms