RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476204.5

HOXB-AS3-208, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXB-AS3, Length 539 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-208ENST00000476204 AACSQ86V21 672 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-208ENST00000476204 OGFOD1Q8N543 542 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FBXW7Q969H0 707 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ADORA1P30542 326 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GMLQ99445 158 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 POTECB2RU33 542 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PHKA1P46020 1223 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IGSF3O75054 1194 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 USP17L8P0C7I0 530 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SCNN1DP51172 638 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SMC5Q8IY18 1101 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF609O15014 1411 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MRIQ9BWK5 157 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IGHDP01880 384 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EPHX2P34913 555 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 WDR90Q96KV7 1748 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EPS15P42566 896 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MICALL2Q8IY33 904 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SPATA5Q8NB90 893 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UTRNP46939 3433 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SCN4AP35499 1836 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SCN9AQ15858 1988 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KIF3CO14782 793 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RASGRF1Q13972 1273 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CERS5Q8N5B7 392 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GPATCH3Q96I76 525 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MAST3O60307 1309 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TOMM70O94826 608 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MXD3Q9BW11 206 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PSME4Q14997 1843 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ATP5JP18859 108 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 JAG2Q9Y219 1238 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MCAMP43121 646 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLF2Q8IX21 1173 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BCL11AQ9H165 835 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LDHDQ86WU2 507 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NUCB1Q02818 461 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DLGAP5Q15398 846 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ABCF2Q9UG63 623 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ERC2O15083 957 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LDHCP07864 332 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 F8W031 263 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SCARF1Q14162 830 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms