RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474088.1

PKD1-211, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 923 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-211	ENST00000474088	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
PKD1-211	ENST00000474088	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PKD1-211	ENST00000474088		A0A1B0GUL6	1792 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PKD1-211	ENST00000474088	ZNF521	Q96K83	1311 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PKD1-211	ENST00000474088	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PKD1-211	ENST00000474088	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
PKD1-211	ENST00000474088	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61
PKD1-211	ENST00000474088	PRKG1	Q13976	671 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PKD1-211	ENST00000474088	SUCLG2	Q96I99	432 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PKD1-211	ENST00000474088		F8W031	263 aa	Predicted RBP	31.34	■■■□□ 2.61
PKD1-211	ENST00000474088	KAZALD1	Q96I82	304 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PKD1-211	ENST00000474088	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PKD1-211	ENST00000474088	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
PKD1-211	ENST00000474088	TM4SF4	P48230	202 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PKD1-211	ENST00000474088	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PKD1-211	ENST00000474088	UBE4A	Q14139	1066 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	CFAP100	Q494V2	611 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	JAG2	Q9Y219	1238 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	UTY	O14607	1347 aa		31.3	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	MYO1B	O43795	1136 aa		31.3	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	31.3	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		31.29	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	SPDYE6	P0CI01	402 aa		31.29	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		31.29	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	TBC1D8	O95759	1140 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	FZD1	Q9UP38	647 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	CLRN2	A0PK11	232 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	GYG1	P46976	350 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
PKD1-211	ENST00000474088	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	31.26	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	SREBF2	Q12772	1141 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	MAP3K11	Q16584	847 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	31.25	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	SPRYD7	Q5W111	196 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	AOX1	Q06278	1338 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	VEZT	Q9HBM0	779 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	PTPRC	P08575	1304 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088		E9PSI1	815 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	GPR25	O00155	361 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	31.21	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	UNCX	A6NJT0	531 aa		31.2	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	RASA3	Q14644	834 aa		31.2	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	LRRC24	Q50LG9	513 aa		31.2	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		31.2	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		31.2	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		31.2	■■■□□ 2.59
PKD1-211	ENST00000474088	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	INHBE	P58166	350 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	SLFN5	Q08AF3	891 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	METTL24	Q5JXM2	366 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	USP44	Q9H0E7	712 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	VPS37D	Q86XT2	251 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	PDE8B	O95263	885 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	ALDH1A1	P00352	501 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	31.16	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	TNFAIP1	Q13829	316 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	WNK4	Q96J92	1243 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	SOX10	P56693	466 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	31.15	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	CRK	P46108	304 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	IFNL1	Q8IU54	200 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PKD1-211	ENST00000474088	FKTN	O75072	461 aa		31.13	■■■□□ 2.57

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