RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472177.2

TNNT2-217, Transcript of troponin T2, cardiac type, human

TSL 3

Gene TNNT2, Length 559 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNT2-217	ENST00000472177	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	CDCA5	Q96FF9	252 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	TNS4	Q8IZW8	715 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	MIER1	Q8N108	512 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	EYA2	O00167	538 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	FOXN1	O15353	648 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	MXD3	Q9BW11	206 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	SNAP23	O00161	211 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	LRRC24	Q50LG9	513 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	CIAO1	O76071	339 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	SLC5A1	P13866	664 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	GYG1	P46976	350 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	13.47	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	TNFAIP1	Q13829	316 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	LPIN2	Q92539	896 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	MAST3	O60307	1309 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177		F8W031	263 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TNNT2-217	ENST00000472177	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	AOC2	O75106	756 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	SPDYE6	P0CI01	402 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	LBX1	P52954	281 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	CERS5	Q8N5B7	392 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	SLC10A3	P09131	477 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	TRIM27	P14373	513 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	TNNI2	P48788	182 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	MEIS3	Q99687	375 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	UNCX	A6NJT0	531 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	GNAI2	P04899	355 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	FGFR2	P21802	821 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	DLK2	Q6UY11	383 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	SIL1	Q9H173	461 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	JAG2	Q9Y219	1238 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	SEMA3E	O15041	775 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	SRGAP3	O43295	1099 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	BCAR3	O75815	825 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	MTX1	Q13505	466 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	MS4A1	P11836	297 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	CRK	P46108	304 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	BCAM	P50895	628 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TNNT2-217	ENST00000472177	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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