RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.36■■□□□ 1.49
SHQ1-206ENST00000471526 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SHQ1-206ENST00000471526 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SHQ1-206ENST00000471526 SUCLG2Q96I99 432 aa24.35■■□□□ 1.49
SHQ1-206ENST00000471526 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.35■■□□□ 1.49
SHQ1-206ENST00000471526 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.34■■□□□ 1.49
SHQ1-206ENST00000471526 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SHQ1-206ENST00000471526 CACNA1FO60840 1977 aa24.34■■□□□ 1.49
SHQ1-206ENST00000471526 RGS19P49795 217 aa24.33■■□□□ 1.49
SHQ1-206ENST00000471526 CFAP100Q494V2 611 aa24.33■■□□□ 1.49
SHQ1-206ENST00000471526 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SHQ1-206ENST00000471526 FZD1Q9UP38 647 aa24.33■■□□□ 1.49
SHQ1-206ENST00000471526 TBC1D8O95759 1140 aa24.32■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.32■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 CLRN2A0PK11 232 aa24.31■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 MYO1BO43795 1136 aa24.31■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 KAZALD1Q96I82 304 aa24.31■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 TM4SF4P48230 202 aa24.3■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 UBE4AQ14139 1066 aa24.3■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 VEZTQ9HBM0 779 aa24.3■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF521Q96K83 1311 aa24.3■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.29■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 SPDYE6P0CI01 402 aa24.29■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 GYG1P46976 350 aa24.29■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.29■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 SREBF2Q12772 1141 aa24.27■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 SPRYD7Q5W111 196 aa24.27■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.27■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.27■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.27■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.27■■□□□ 1.48
SHQ1-206ENST00000471526 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.26■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.26■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 UTYO14607 1347 aa24.26■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 AOX1Q06278 1338 aa24.26■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.25■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 E9PSI1 815 aa24.24■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 LRRC24Q50LG9 513 aa24.24■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.24■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 GPR25O00155 361 aa24.23■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 SOX10P56693 466 aa24.23■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 RASA3Q14644 834 aa24.23■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 MAP3K11Q16584 847 aa24.23■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 METTL24Q5JXM2 366 aa24.23■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 VPS37DQ86XT2 251 aa24.23■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.23■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.23■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.23■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 PTPRCP08575 1304 aa24.22■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.21■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.21■■□□□ 1.47
SHQ1-206ENST00000471526 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 SLFN5Q08AF3 891 aa24.2■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.2■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.2■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.2■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 A0A1B0GUL6 1792 aa24.19■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 SPDYE2Q495Y8 402 aa24.19■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.19■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 WNK4Q96J92 1243 aa24.19■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 USP44Q9H0E7 712 aa24.19■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.19■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 PDE8BO95263 885 aa24.18■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 CRKP46108 304 aa24.18■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 INHBEP58166 350 aa24.18■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 TNFAIP1Q13829 316 aa24.18■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 GRIK5Q16478 980 aa24.18■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 TCP10L2B9ZVM9 353 aa24.17■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 FKTNO75072 461 aa24.17■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 ALDH1A1P00352 501 aa24.17■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SHQ1-206ENST00000471526 IFNL1Q8IU54 200 aa24.17■■□□□ 1.46
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