RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461648.2

TSC2-208, Transcript of TSC complex subunit 2, human

TSL 2

Gene TSC2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC2-208	ENST00000461648	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		31.26	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		31.26	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	JAG2	Q9Y219	1238 aa		31.26	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	WDR90	Q96KV7	1748 aa		31.26	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	31.25	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	31.25	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	31.25	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		31.25	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		31.24	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	31.23	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	RASGRF1	Q13972	1273 aa		31.23	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	31.23	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	MXD3	Q9BW11	206 aa		31.23	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		31.23	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		31.22	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	SCN4A	P35499	1836 aa		31.21	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	31.21	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	SCNN1D	P51172	638 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	NUCB1	Q02818	461 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	CERS5	Q8N5B7	392 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	DPF2	Q92785	391 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	GML	Q99445	158 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TSC2-208	ENST00000461648	MCAM	P43121	646 aa		31.19	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	SCARF1	Q14162	830 aa		31.19	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		31.19	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		31.19	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	SPATA5	Q8NB90	893 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	LNPK	Q9C0E8	428 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	RRAGC	Q9HB90	399 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	POTEC	B2RU33	542 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	PI16	Q6UXB8	463 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	GPATCH3	Q96I76	525 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	31.16	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	HACL1	Q9UJ83	578 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	31.15	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	SNRK	Q9NRH2	765 aa		31.15	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		31.15	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		31.15	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		31.15	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	31.14	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	EPS15	P42566	896 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	MICALL2	Q8IY33	904 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TSC2-208	ENST00000461648	SHTN1	A0MZ66	631 aa		31.13	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	USP17L8	P0C7I0	530 aa		31.13	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	ATP5J	P18859	108 aa		31.13	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648		H7C1D1	291 aa		31.12	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	ZAP70	P43403	619 aa		31.12	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		31.12	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		31.12	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648		F8W031	263 aa	Predicted RBP	31.11	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	MX1	P20591	662 aa		31.11	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	GRIK5	Q16478	980 aa		31.11	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		31.11	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		31.11	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	EPHX2	P34913	555 aa		31.1	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	MMP14	P50281	582 aa		31.1	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	OGFOD1	Q8N543	542 aa		31.1	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		31.1	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	ABCF2	Q9UG63	623 aa		31.1	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		31.09	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	31.08	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	31.08	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		31.08	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		31.08	■■■□□ 2.57
TSC2-208	ENST00000461648	PRDX5	P30044	214 aa		31.07	■■■□□ 2.56
TSC2-208	ENST00000461648	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	31.07	■■■□□ 2.56
TSC2-208	ENST00000461648	HAUS7	Q99871	368 aa		31.07	■■■□□ 2.56
TSC2-208	ENST00000461648	STAP2	Q9UGK3	403 aa		31.07	■■■□□ 2.56
TSC2-208	ENST00000461648	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	31.06	■■■□□ 2.56
TSC2-208	ENST00000461648	MAST3	O60307	1309 aa		31.06	■■■□□ 2.56
TSC2-208	ENST00000461648	ERC2	O15083	957 aa		31.06	■■■□□ 2.56
TSC2-208	ENST00000461648	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		31.06	■■■□□ 2.56
TSC2-208	ENST00000461648	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		31.06	■■■□□ 2.56

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