RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452811.1

LRRTM1-207, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

TSL 5

Gene LRRTM1, Length 765 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-207ENST00000452811 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
LRRTM1-207ENST00000452811 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.04■■□□□ 1.28
LRRTM1-207ENST00000452811 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.04■■□□□ 1.28
LRRTM1-207ENST00000452811 FKBP1BP68106 108 aa23.03■■□□□ 1.28
LRRTM1-207ENST00000452811 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.03■■□□□ 1.28
LRRTM1-207ENST00000452811 CCDC102AQ96A19 550 aa23.03■■□□□ 1.28
LRRTM1-207ENST00000452811 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.03■■□□□ 1.28
LRRTM1-207ENST00000452811 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
LRRTM1-207ENST00000452811 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
LRRTM1-207ENST00000452811 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
LRRTM1-207ENST00000452811 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.02■■□□□ 1.28
LRRTM1-207ENST00000452811 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.01■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 ZIC5Q96T25 663 aa23.01■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 CA12O43570 354 aa23■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 PDE8BO95263 885 aa23■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 GYG1P46976 350 aa23■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 MIER1Q8N108 512 aa23■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 DLGAP5Q15398 846 aa22.99■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 METTL24Q5JXM2 366 aa22.99■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 SLC10A3P09131 477 aa22.98■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.98■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.97■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 JAG2Q9Y219 1238 aa22.97■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 KIF16BQ96L93 1317 aa22.97■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.96■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 F8W031 263 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 EYA2O00167 538 aa22.96■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 SPDYE6P0CI01 402 aa22.96■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 FGFR2P21802 821 aa22.96■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 CFAP100Q494V2 611 aa22.96■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 FBXO3Q9UK99 471 aa22.96■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.96■■□□□ 1.27
LRRTM1-207ENST00000452811 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.95■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.95■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.95■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.94■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.94■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.94■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 NF2P35240 595 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 MOB2Q70IA6 237 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 VPS37DQ86XT2 251 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 MYO1BO43795 1136 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 CIAO1O76071 339 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 TSKSQ9UJT2 592 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 AOX1Q06278 1338 aa22.91■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 BCAMP50895 628 aa22.91■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.91■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 CSRNP1Q96S65 589 aa22.91■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 MEIS3Q99687 375 aa22.91■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.91■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 LPIN2Q92539 896 aa22.9■■□□□ 1.26
LRRTM1-207ENST00000452811 BCAR3O75815 825 aa22.89■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 TRIM27P14373 513 aa22.89■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.89■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 COPRSQ9NQ92 184 aa22.89■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 CLRN2A0PK11 232 aa22.88■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 GNAI3P08754 354 aa22.88■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 GRIK5Q16478 980 aa22.88■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 MAP3K11Q16584 847 aa22.88■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.88■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.88■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.88■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 MRIQ9BWK5 157 aa22.88■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 SLC5A1P13866 664 aa22.87■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 CRKP46108 304 aa22.87■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 MTX1Q13505 466 aa22.87■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 RNF186Q9NXI6 227 aa22.87■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.87■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.86■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 ZBTB22O15209 634 aa22.86■■□□□ 1.25
LRRTM1-207ENST00000452811 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms