RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 GNAI3P08754 354 aa34.62■■■■□ 3.13
FAAP20-210ENST00000440825 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa34.62■■■■□ 3.13
FAAP20-210ENST00000440825 SAPCD2Q86UD0 394 aa34.62■■■■□ 3.13
FAAP20-210ENST00000440825 VGLL2Q8N8G2 317 aa34.62■■■■□ 3.13
FAAP20-210ENST00000440825 CAPNS2Q96L46 248 aa34.62■■■■□ 3.13
FAAP20-210ENST00000440825 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
FAAP20-210ENST00000440825 WNT10BO00744 389 aa34.6■■■■□ 3.13
FAAP20-210ENST00000440825 CAVIN4Q5BKX8 364 aa34.6■■■■□ 3.13
FAAP20-210ENST00000440825 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
FAAP20-210ENST00000440825 ECE1P42892 770 aa34.59■■■■□ 3.13
FAAP20-210ENST00000440825 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
FAAP20-210ENST00000440825 CDCA5Q96FF9 252 aa34.59■■■■□ 3.13
FAAP20-210ENST00000440825 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
FAAP20-210ENST00000440825 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
FAAP20-210ENST00000440825 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
FAAP20-210ENST00000440825 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa34.57■■■■□ 3.13
FAAP20-210ENST00000440825 MMP14P50281 582 aa34.57■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 HUNKP57058 714 aa34.57■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 C2orf69Q8N8R5 385 aa34.57■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 DLGAP5Q15398 846 aa34.56■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 ATG9AQ7Z3C6 839 aa34.56■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM57Q8N5G2 664 aa34.56■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 MFSD14BQ5SR56 506 aa34.55■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 FBXO33Q7Z6M2 555 aa34.55■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 AIDAQ96BJ3 306 aa34.55■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 BCAMP50895 628 aa34.54■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP34.54■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa34.54■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 FAM205AQ6ZU69 1335 aa34.54■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 SRGAP3O43295 1099 aa34.53■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 AOC2O75106 756 aa34.53■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 SLC5A1P13866 664 aa34.53■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa34.53■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 GNAI2P04899 355 aa34.52■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 CFAP100Q494V2 611 aa34.52■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 CEP126Q9P2H0 1117 aa34.52■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 CIAO1O76071 339 aa34.51■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 FGFR2P21802 821 aa34.51■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 LPIN2Q92539 896 aa34.51■■■■□ 3.12
FAAP20-210ENST00000440825 HHIPL1Q96JK4 782 aa34.5■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 FBXO3Q9UK99 471 aa34.5■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 FOXN1O15353 648 aa34.48■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 IL15P40933 162 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 ATP2B3Q16720 1220 aa34.48■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 COPRSQ9NQ92 184 aa34.48■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 ITPRIPQ8IWB1 547 aa34.47■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 WBP1LQ9NX94 342 aa34.47■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 CLRN2A0PK11 232 aa34.46■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 MYO1BO43795 1136 aa34.46■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 RGMBQ6NW40 437 aa34.45■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 MTMR14Q8NCE2 650 aa34.45■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 VEZTQ9HBM0 779 aa34.45■■■■□ 3.11
FAAP20-210ENST00000440825 SPDYE2BA6NHP3 402 aa34.44■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 SPDYE6P0CI01 402 aa34.44■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 BEGAINQ9BUH8 593 aa34.44■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 ARAP2Q8WZ64 1704 aa34.44■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 RLBP1P12271 317 aa34.43■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 NF2P35240 595 aa34.43■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 MTX1Q13505 466 aa34.43■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 GRIK5Q16478 980 aa34.43■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 MOB2Q70IA6 237 aa34.43■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa34.43■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 THSD7BQ9C0I4 1608 aa34.42■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 AOX1Q06278 1338 aa34.41■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 MAP2K2P36507 400 aa34.41■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 PRKG1Q13976 671 aa34.41■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 C1orf115Q9H7X2 142 aa34.41■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa34.4■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 DEFB129Q9H1M3 183 aa34.4■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 SERPINA10Q9UK55 444 aa34.4■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 ECM29Q5VYK3 1845 aa34.39■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa34.39■■■■□ 3.1
FAAP20-210ENST00000440825 MYH13Q9UKX3 1938 aa34.38■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 UBE2Q2LH0YL09 131 aa34.38■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 CRKP46108 304 aa34.38■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 FKBP1BP68106 108 aa34.38■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 TFCP2Q12800 502 aa34.38■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 NOGQ13253 232 aa34.38■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 ADORA1P30542 326 aa34.37■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 PANK1Q8TE04 598 aa34.37■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC102AQ96A19 550 aa34.37■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 ZIC5Q96T25 663 aa34.37■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 TIMM10P62072 90 aa34.36■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
FAAP20-210ENST00000440825 PHKA1P46020 1223 aa34.35■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms