RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 USP44Q9H0E7 712 aa23.58■■□□□ 1.37
CCDC78-204ENST00000439619 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.58■■□□□ 1.37
CCDC78-204ENST00000439619 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.57■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 F8W031 263 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.56■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 CERS5Q8N5B7 392 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 SLC10A3P09131 477 aa23.54■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 GYG1P46976 350 aa23.54■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.54■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 PDE8BO95263 885 aa23.53■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.53■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.53■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.53■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 TSKSQ9UJT2 592 aa23.53■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 JAG2Q9Y219 1238 aa23.53■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 KIF16BQ96L93 1317 aa23.53■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 CFAP100Q494V2 611 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 LRRC24Q50LG9 513 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC78-204ENST00000439619 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.51■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 ZIC5Q96T25 663 aa23.51■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.51■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 SPDYE6P0CI01 402 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 VEZTQ9HBM0 779 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 EYA2O00167 538 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 TNFAIP1Q13829 316 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 FBXO3Q9UK99 471 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 SLC5A1P13866 664 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 MOB2Q70IA6 237 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 A0A1B0GUL6 1792 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 CLRN2A0PK11 232 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 PRKG1Q13976 671 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 CSRNP1Q96S65 589 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC78-204ENST00000439619 TRPA1O75762 1119 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 LPIN2Q92539 896 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 RNF186Q9NXI6 227 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 CIAO1O76071 339 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 GNAI3P08754 354 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 ABHD8Q96I13 439 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 TNNI2P48788 182 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 MAST3O60307 1309 aa23.42■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 CRKP46108 304 aa23.42■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 BCAMP50895 628 aa23.42■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 SREBF2Q12772 1141 aa23.42■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 SIL1Q9H173 461 aa23.42■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.42■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.42■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 UNCXA6NJT0 531 aa23.41■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 FGFR2P21802 821 aa23.41■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 RASA3Q14644 834 aa23.41■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.41■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 TEKT1Q969V4 418 aa23.41■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.41■■□□□ 1.34
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms