RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439368.6

ARHGEF4-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 4, human

TSL 5

Gene ARHGEF4, Length 901 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARHGEF4-208	ENST00000439368	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
ARHGEF4-208	ENST00000439368		F8W031	263 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
ARHGEF4-208	ENST00000439368	SASH1	O94885	1247 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ARHGEF4-208	ENST00000439368	ECE1	P42892	770 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ARHGEF4-208	ENST00000439368	GNAI3	P08754	354 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ARHGEF4-208	ENST00000439368	VPS37D	Q86XT2	251 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ARHGEF4-208	ENST00000439368	CDCA5	Q96FF9	252 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ARHGEF4-208	ENST00000439368	SIL1	Q9H173	461 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ARHGEF4-208	ENST00000439368	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
ARHGEF4-208	ENST00000439368	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		27.89	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	PCNT	O95613	3336 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	HUNK	P57058	714 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	DLGAP5	Q15398	846 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	FGFR2	P21802	821 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	BCAM	P50895	628 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	FBXO3	Q9UK99	471 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	AOC2	O75106	756 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	CIAO1	O76071	339 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	AIDA	Q96BJ3	306 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	WBP1L	Q9NX94	342 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARHGEF4-208	ENST00000439368	FOXN1	O15353	648 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	SLC5A1	P13866	664 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	CFAP100	Q494V2	611 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	SRGAP3	O43295	1099 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	LPIN2	Q92539	896 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	COPRS	Q9NQ92	184 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	GNAI2	P04899	355 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	27.8	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	RGMB	Q6NW40	437 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	MAP2K2	P36507	400 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	ATP2B3	Q16720	1220 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	MYO1B	O43795	1136 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	SPDYE6	P0CI01	402 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	MTX1	Q13505	466 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
ARHGEF4-208	ENST00000439368	CLRN2	A0PK11	232 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	GRIK5	Q16478	980 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	MOB2	Q70IA6	237 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	AOX1	Q06278	1338 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	RLBP1	P12271	317 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	NF2	P35240	595 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	FKBP1B	P68106	108 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	NOG	Q13253	232 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	ZIC5	Q96T25	663 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	VEZT	Q9HBM0	779 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	CRK	P46108	304 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	CCDC102A	Q96A19	550 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ARHGEF4-208	ENST00000439368	LBX1	P52954	281 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ARHGEF4-208	ENST00000439368	TFCP2	Q12800	502 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ARHGEF4-208	ENST00000439368	PRKG1	Q13976	671 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ARHGEF4-208	ENST00000439368	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
ARHGEF4-208	ENST00000439368	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ARHGEF4-208	ENST00000439368	ADORA1	P30542	326 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ARHGEF4-208	ENST00000439368	TIMM10	P62072	90 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ARHGEF4-208	ENST00000439368	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ARHGEF4-208	ENST00000439368	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms