RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436673.5

UPP1-208, Transcript of uridine phosphorylase 1, human

TSL 5

Gene UPP1, Length 918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UPP1-208	ENST00000436673	PLIN1	O60240	522 aa		33.44	■■■□□ 2.94
UPP1-208	ENST00000436673	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		33.44	■■■□□ 2.94
UPP1-208	ENST00000436673	SUCLG2	Q96I99	432 aa		33.44	■■■□□ 2.94
UPP1-208	ENST00000436673	RGS19	P49795	217 aa		33.43	■■■□□ 2.94
UPP1-208	ENST00000436673	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
UPP1-208	ENST00000436673	KAZALD1	Q96I82	304 aa		33.43	■■■□□ 2.94
UPP1-208	ENST00000436673	UTY	O14607	1347 aa		33.41	■■■□□ 2.94
UPP1-208	ENST00000436673	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
UPP1-208	ENST00000436673	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
UPP1-208	ENST00000436673	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		33.4	■■■□□ 2.94
UPP1-208	ENST00000436673	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		33.4	■■■□□ 2.94
UPP1-208	ENST00000436673	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		33.4	■■■□□ 2.94
UPP1-208	ENST00000436673		F8W031	263 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
UPP1-208	ENST00000436673	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
UPP1-208	ENST00000436673	PRKG1	Q13976	671 aa		33.39	■■■□□ 2.94
UPP1-208	ENST00000436673	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
UPP1-208	ENST00000436673	JAG2	Q9Y219	1238 aa		33.39	■■■□□ 2.94
UPP1-208	ENST00000436673	UBE4A	Q14139	1066 aa		33.38	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	CFAP100	Q494V2	611 aa		33.38	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		33.38	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		33.37	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	SPDYE6	P0CI01	402 aa		33.37	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		33.36	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	TM4SF4	P48230	202 aa		33.36	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		33.35	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		33.35	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	MYO1B	O43795	1136 aa		33.34	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	CLRN2	A0PK11	232 aa		33.33	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673		E9PSI1	815 aa		33.33	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	GYG1	P46976	350 aa		33.33	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	FZD1	Q9UP38	647 aa		33.33	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	PTPRC	P08575	1304 aa		33.32	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	AOX1	Q06278	1338 aa		33.32	■■■□□ 2.93
UPP1-208	ENST00000436673	TBC1D8	O95759	1140 aa		33.32	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		33.31	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		33.31	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	MAP3K11	Q16584	847 aa		33.31	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		33.31	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	SREBF2	Q12772	1141 aa		33.3	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		33.3	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	SPRYD7	Q5W111	196 aa		33.3	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		33.3	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	33.29	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	VEZT	Q9HBM0	779 aa		33.29	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		33.29	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		33.28	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	SLFN5	Q08AF3	891 aa		33.27	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	LRRC24	Q50LG9	513 aa		33.27	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		33.27	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
UPP1-208	ENST00000436673	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		33.26	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	RASA3	Q14644	834 aa		33.25	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		33.25	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	USP44	Q9H0E7	712 aa		33.25	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	METTL24	Q5JXM2	366 aa		33.24	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		33.24	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		33.24	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	UNCX	A6NJT0	531 aa		33.23	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	GPR25	O00155	361 aa		33.23	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		33.23	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		33.23	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	VPS37D	Q86XT2	251 aa		33.22	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	PDE8B	O95263	885 aa		33.21	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		33.21	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	INHBE	P58166	350 aa		33.2	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	TNFAIP1	Q13829	316 aa		33.2	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		33.2	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	WNK4	Q96J92	1243 aa		33.2	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		33.2	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
UPP1-208	ENST00000436673	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	CRK	P46108	304 aa		33.19	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	GRIK5	Q16478	980 aa		33.19	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		33.19	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		33.19	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		33.19	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	ALDH1A1	P00352	501 aa		33.18	■■■□□ 2.9

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms