RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429794.1

CITED1-205, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-205ENST00000429794 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.73■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 CERS5Q8N5B7 392 aa15.73■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 CHMP3Q9Y3E7 222 aa15.73■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 ARAP2Q8WZ64 1704 aa15.73■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 UNCXA6NJT0 531 aa15.72■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 MYO1BO43795 1136 aa15.72■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 ALDH1L1O75891 902 aa15.72■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 MAP3K11Q16584 847 aa15.72■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 LMBR1LQ6UX01 489 aa15.72■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 DEFB129Q9H1M3 183 aa15.72■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 SNAP23O00161 211 aa15.71■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 TAF7LQ5H9L4 462 aa15.71■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa15.71■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.7■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 GPR25O00155 361 aa15.7■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 SLC34A2O95436 690 aa15.7■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 TBC1D8O95759 1140 aa15.7■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 ALDH1A1P00352 501 aa15.7■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 SPDYE6P0CI01 402 aa15.7■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 EPHA10Q5JZY3 1008 aa15.7■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 SPRYD7Q5W111 196 aa15.7■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 CNNM1Q9NRU3 951 aa15.7■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 SSC5DA1L4H1 1573 aa15.7■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 FAM205AQ6ZU69 1335 aa15.69■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 INHBEP58166 350 aa15.69■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 PRKG1Q13976 671 aa15.69■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 UBE4AQ14139 1066 aa15.69■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.69■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 CFAP100Q494V2 611 aa15.69■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa15.69■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 HPS5Q9UPZ3 1129 aa15.69■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 SOX10P56693 466 aa15.68■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 F8W031 263 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 TNFAIP1Q13829 316 aa15.67■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 SLC10A4Q96EP9 437 aa15.67■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 UTYO14607 1347 aa15.67■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 OTOFQ9HC10 1997 aa15.66■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 CLRN2A0PK11 232 aa15.66■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 PLIN1O60240 522 aa15.66■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 FKTNO75072 461 aa15.66■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 MFSD14BQ5SR56 506 aa15.66■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 SLC4A10Q6U841 1118 aa15.66■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 SERPINA10Q9UK55 444 aa15.66■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa15.66■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 MROH5Q6ZUA9 1318 aa15.66■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 IREB2P48200 963 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 IFNL1Q8IU54 200 aa15.65■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 KAZALD1Q96I82 304 aa15.65■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 SUCLG2Q96I99 432 aa15.65■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 WNK4Q96J92 1243 aa15.65■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 VEZTQ9HBM0 779 aa15.65■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 ZNF521Q96K83 1311 aa15.65■□□□□ 0.1
CITED1-205ENST00000429794 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP15.64■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 RASA3Q14644 834 aa15.64■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.64■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa15.64■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 FZD1Q9UP38 647 aa15.64■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 JAG2Q9Y219 1238 aa15.64■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa15.64■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 GYG1P46976 350 aa15.63■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 CLMNQ96JQ2 1002 aa15.63■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 PTPRCP08575 1304 aa15.63■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 AOX1Q06278 1338 aa15.63■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 USP2O75604 605 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa15.62■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa15.62■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 FBXO33Q7Z6M2 555 aa15.61■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 VPS37DQ86XT2 251 aa15.61■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa15.61■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 MYH13Q9UKX3 1938 aa15.6■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 HTTP42858 3142 aa15.6■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CITED1-205ENST00000429794 CRKP46108 304 aa15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms