RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	13.63	□□□□□ -0.23	2e-6	■□□□□ 8.1
UBXN7-205	ENST00000429160	FBXW7	Q969H0	707 aa		13.63	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.63	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	TNN	Q9UQP3	1299 aa		13.63	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		13.63	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.62	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.62	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		13.62	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.62	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	RLBP1	P12271	317 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	KLRG1	Q96E93	195 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	LAMB1	P07942	1786 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	HMMR	O75330	724 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	GYG1	P46976	350 aa		13.61	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	CNTNAP1	P78357	1384 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	SCARF1	Q14162	830 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	FKBP1B	P68106	108 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	SULF1	Q8IWU6	871 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	SIL1	Q9H173	461 aa		13.6	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	MYO1B	O43795	1136 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	JMY	Q8N9B5	988 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	RASSF10	A6NK89	507 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	DLGAP5	Q15398	846 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	CEP85	Q6P2H3	762 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	PANK1	Q8TE04	598 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	SHTN1	A0MZ66	631 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	GGA3	Q9NZ52	723 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	SNAP23	O00161	211 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	AAMP	Q13685	434 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	CERS5	Q8N5B7	392 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	ECE1	P42892	770 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	TFCP2	Q12800	502 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	BCAM	P50895	628 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	USP48	Q86UV5	1035 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	SLF2	Q8IX21	1173 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	UNCX	A6NJT0	531 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	WNT10B	O00744	389 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	RAB11FIP3	O75154	756 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160		A0A1B0GUL7	405 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	NF2	P35240	595 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	TNFAIP1	Q13829	316 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	SPDYE6	P0CI01	402 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	XAGE2	Q96GT9	111 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	MXD3	Q9BW11	206 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	CDCA5	Q96FF9	252 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	COG6	Q9Y2V7	657 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	TNNI2	P48788	182 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	EGFR	P00533	1210 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	CRK	P46108	304 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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