RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428946.5

LRRC23-204, Transcript of leucine rich repeat containing 23, humanhuman

TSL 3

Gene LRRC23, Length 969 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23-204ENST00000428946 JAG2Q9Y219 1238 aa22.95■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.94■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 MOB2Q70IA6 237 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 CERS5Q8N5B7 392 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 F8W031 263 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 TRIM27P14373 513 aa22.91■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.91■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.9■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.9■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.9■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.9■■□□□ 1.26
LRRC23-204ENST00000428946 SLC10A3P09131 477 aa22.89■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 IL1R1P14778 569 aa22.89■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 CCDC102AQ96A19 550 aa22.89■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.88■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 CA12O43570 354 aa22.88■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.88■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.88■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 MEIS3Q99687 375 aa22.88■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.87■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 GYG1P46976 350 aa22.87■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 LRRC24Q50LG9 513 aa22.86■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.86■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.86■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 FKBP1BP68106 108 aa22.85■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 PRKG1Q13976 671 aa22.85■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 DLGAP5Q15398 846 aa22.85■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 ABHD8Q96I13 439 aa22.85■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 AOX1Q06278 1338 aa22.84■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 UBE4AQ14139 1066 aa22.84■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 CLRN2A0PK11 232 aa22.83■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 MMP14P50281 582 aa22.83■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 CFAP100Q494V2 611 aa22.83■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.83■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 FZD1Q9UP38 647 aa22.83■■□□□ 1.25
LRRC23-204ENST00000428946 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.82■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 NF2P35240 595 aa22.82■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 METTL24Q5JXM2 366 aa22.82■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 CSRNP1Q96S65 589 aa22.82■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 TRPA1O75762 1119 aa22.81■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 GNAI3P08754 354 aa22.81■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.81■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 RNF186Q9NXI6 227 aa22.81■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.81■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.81■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.8■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 SPDYE6P0CI01 402 aa22.8■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 VEZTQ9HBM0 779 aa22.8■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.8■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.79■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.79■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.79■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.79■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 EYA2O00167 538 aa22.78■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 RLBP1P12271 317 aa22.78■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.78■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 SIL1Q9H173 461 aa22.78■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.78■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 MYO1BO43795 1136 aa22.77■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 PDE8BO95263 885 aa22.77■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 GRIK5Q16478 980 aa22.77■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 VPS37DQ86XT2 251 aa22.77■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
LRRC23-204ENST00000428946 DGKZQ13574 1117 aa22.76■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.76■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.76■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.75■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 GNAI2P04899 355 aa22.75■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms