RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417464.6

UPP1-205, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 782 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-205ENST00000417464 GRM1Q13255 1194 aa24.12■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.12■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.12■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 OGFOD1Q8N543 542 aa24.12■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 AOX1Q06278 1338 aa24.11■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.11■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 RASSF10A6NK89 507 aa24.11■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 GRIK5Q16478 980 aa24.11■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 WNT10BO00744 389 aa24.1■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 GNAI2P04899 355 aa24.1■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa24.1■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 VPS37DQ86XT2 251 aa24.1■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 SULF1Q8IWU6 871 aa24.1■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.1■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 CIAO1O76071 339 aa24.09■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 DEFB115Q30KQ5 88 aa24.09■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 CYP4F22Q6NT55 531 aa24.09■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 TLL2Q9Y6L7 1015 aa24.09■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.09■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.08■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 CDCA5Q96FF9 252 aa24.08■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 COPRSQ9NQ92 184 aa24.08■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.08■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 MTX1Q13505 466 aa24.07■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 ATP2B3Q16720 1220 aa24.07■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.07■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 SAPCD2Q86UD0 394 aa24.07■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.07■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 SLC5A1P13866 664 aa24.06■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 ADORA1P30542 326 aa24.06■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 LPIN2Q92539 896 aa24.06■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.06■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 TFCP2Q12800 502 aa24.05■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 CFAP100Q494V2 611 aa24.05■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 CAPNS2Q96L46 248 aa24.05■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 CLRN2A0PK11 232 aa24.04■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 DLGAP5Q15398 846 aa24.04■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.04■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 AOC2O75106 756 aa24.03■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 MOB2Q70IA6 237 aa24.03■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 FBXO3Q9UK99 471 aa24.03■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.03■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 PHKA1P46020 1223 aa24.02■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 HUNKP57058 714 aa24.02■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
UPP1-205ENST00000417464 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.01■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 SPDYE6P0CI01 402 aa24.01■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 TIMM10P62072 90 aa24.01■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.01■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 POLA2Q14181 598 aa23.99■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.99■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 FZD1Q9UP38 647 aa23.99■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 COG6Q9Y2V7 657 aa23.99■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.98■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.98■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 ZIC5Q96T25 663 aa23.98■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 VEZTQ9HBM0 779 aa23.98■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 A0A1B0GUL7 405 aa23.97■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 CRKP46108 304 aa23.97■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 ATP8B2P98198 1209 aa23.97■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 PRKG1Q13976 671 aa23.97■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 FOXN1O15353 648 aa23.96■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 CCDC102BQ68D86 513 aa23.96■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 SSH3Q8TE77 659 aa23.96■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23.95■■□□□ 1.43
UPP1-205ENST00000417464 ECE1P42892 770 aa23.95■■□□□ 1.42
UPP1-205ENST00000417464 MMP14P50281 582 aa23.95■■□□□ 1.42
UPP1-205ENST00000417464 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.42
UPP1-205ENST00000417464 CEP85Q6P2H3 762 aa23.95■■□□□ 1.42
UPP1-205ENST00000417464 XAGE2Q96GT9 111 aa23.95■■□□□ 1.42
UPP1-205ENST00000417464 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.95■■□□□ 1.42
UPP1-205ENST00000417464 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.95■■□□□ 1.42
UPP1-205ENST00000417464 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.95■■□□□ 1.42
UPP1-205ENST00000417464 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.94■■□□□ 1.42
UPP1-205ENST00000417464 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
UPP1-205ENST00000417464 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.94■■□□□ 1.42
UPP1-205ENST00000417464 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.94■■□□□ 1.42
UPP1-205ENST00000417464 PRDX5P30044 214 aa23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms