RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 KCNJ4P48050 445 aa16.92■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 MTMR14Q8NCE2 650 aa16.92■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 CLMNQ96JQ2 1002 aa16.92■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 DEFB129Q9H1M3 183 aa16.92■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 CLRN2A0PK11 232 aa16.91■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.91■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 GRM8O00222 908 aa16.91■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 SPDYE6P0CI01 402 aa16.91■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 HPS5Q9UPZ3 1129 aa16.91■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 CHMP3Q9Y3E7 222 aa16.91■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 MMP14P50281 582 aa16.9■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 CFAP100Q494V2 611 aa16.9■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 SPRYD7Q5W111 196 aa16.9■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 CDAN1Q8IWY9 1227 aa16.9■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 SUCLG2Q96I99 432 aa16.9■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 HDAC9Q9UKV0 1011 aa16.9■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF521Q96K83 1311 aa16.9■□□□□ 0.3
CNGA3-202ENST00000393503 GPR25O00155 361 aa16.89■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 PLIN1O60240 522 aa16.89■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 GJA5P36382 358 aa16.89■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 DLGAP5Q15398 846 aa16.89■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 GRIK5Q16478 980 aa16.89■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 MAP3K11Q16584 847 aa16.89■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa16.88■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 ARMC9Q7Z3E5 817 aa16.88■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 CFHR5Q9BXR6 569 aa16.88■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 CENPFP49454 3210 aa16.88■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 ECM29Q5VYK3 1845 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 NF2P35240 595 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 GYG1P46976 350 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 CAP1Q01518 475 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 ALDH1L1O75891 902 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 SLC4A10Q6U841 1118 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 ANKRD44Q8N8A2 993 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 WNK4Q96J92 1243 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 CNNM1Q9NRU3 951 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 UTYO14607 1347 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 LAMB1P07942 1786 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 ANP32CO43423 234 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 USP2O75604 605 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 RASA3Q14644 834 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 FAM9BQ8IZU0 186 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 VEZTQ9HBM0 779 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 BRCA2P51587 3418 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 OTOFQ9HC10 1997 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 SREBF2Q12772 1141 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 LRRC24Q50LG9 513 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 IFNL1Q8IU54 200 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 TEPSINQ96N21 525 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 UBE4AQ14139 1066 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 MFSD14BQ5SR56 506 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 VGLL2Q8N8G2 317 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 KLHDC4Q8TBB5 520 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 SLC10A4Q96EP9 437 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 PTPN18Q99952 460 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa16.83■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 ARAP2Q8WZ64 1704 aa16.82■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 FKTNO75072 461 aa16.82■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 TAF7LQ5H9L4 462 aa16.82■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 FBXO33Q7Z6M2 555 aa16.82■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.82■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.8■□□□□ 0.28
CNGA3-202ENST00000393503 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms