RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 CNNM3Q8NE01 707 aa12.43□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 REREQ9P2R6 1566 aa12.43□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 SNX14Q9Y5W7 946 aa12.43□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 CKAP2LQ8IYA6 745 aa12.43□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMTC2Q8N394 836 aa12.43□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 IL17REQ8NFR9 667 aa12.43□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa12.43□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 GOPCQ9HD26 462 aa12.43□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 USP16Q9Y5T5 823 aa12.43□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 ENO4A6NNW6 628 aa12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 TADA3O75528 432 aa12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 URI1O94763 535 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 GNAI3P08754 354 aa12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 TYRO3Q06418 890 aa12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 LONRF2Q1L5Z9 754 aa12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 MFSD4BQ5TF39 518 aa12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 RUFY3Q7L099 469 aa12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 IQCA1Q86XH1 822 aa12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 HOMER1Q86YM7 354 aa12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 CABS1Q96KC9 395 aa12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYO1FO00160 1098 aa12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 NLRP6P59044 892 aa12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCZ1BP86790 482 aa12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 APOBRQ0VD83 1088 aa12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 ADCK5Q3MIX3 580 aa12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 DDX11Q96FC9 970 aa12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAI1Q9UI46 699 aa12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 SYT1P21579 422 aa12.41□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 RINLQ6ZS11 566 aa12.41□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 LTKP29376 864 aa12.41□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 PTH1RQ03431 593 aa12.41□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 NAA25Q14CX7 972 aa12.41□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa12.41□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 C3orf20Q8ND61 904 aa12.41□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 RHPN1Q8TCX5 695 aa12.41□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 PARD6BQ9BYG5 372 aa12.41□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM107BQ9H098 131 aa12.41□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 ANAPC4Q9UJX5 808 aa12.41□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 CAPN7Q9Y6W3 813 aa12.41□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM169AQ9Y6X4 670 aa12.41□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa12.4□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 HSPA4P34932 840 aa12.4□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 C3P01024 1663 aa12.4□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1B0GUA9 196 aa12.4□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 EFCAB8A8MWE9 144 aa12.4□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 USP4Q13107 963 aa12.4□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYSM1Q5VVJ2 828 aa12.4□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMC3Q9UQE7 1217 aa12.4□□□□□ -0.42
APOBEC3C-201ENST00000361441 GNAT3A8MTJ3 354 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHUKO15111 745 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 PPFIA2O75334 1257 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM87AQ8NBN3 555 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 PI4K2BQ8TCG2 481 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHPF2Q9P2E5 772 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 OVOS2Q6IE36 1432 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 MON2Q7Z3U7 1717 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 ITSN1Q15811 1721 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCP110O43303 1012 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 STX6O43752 255 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 INPP5BP32019 993 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCT5P48643 541 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC102AQ96A19 550 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 RMI1Q9H9A7 625 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 LGR6Q9HBX8 967 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 LMCD1Q9NZU5 365 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 USP6P35125 1406 aa12.39□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 PI4KAP2A4QPH2 592 aa12.38□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 RAD21O60216 631 aa12.38□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 NEMFO60524 1076 aa12.38□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 GJB2P29033 226 aa12.38□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 CEP57Q86XR8 500 aa12.38□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa12.38□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPDL1Q96EA4 605 aa12.38□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 CRACR2AQ9BSW2 395 aa12.38□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 RABEP2Q9H5N1 569 aa12.38□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
APOBEC3C-201ENST00000361441 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms