RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356455.8

UBE2C-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2C, Length 850 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-204ENST00000356455 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.6■■□□□ 1.37
UBE2C-204ENST00000356455 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
UBE2C-204ENST00000356455 UNCXA6NJT0 531 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2C-204ENST00000356455 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
UBE2C-204ENST00000356455 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2C-204ENST00000356455 HTTP42858 3142 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2C-204ENST00000356455 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
UBE2C-204ENST00000356455 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.58■■□□□ 1.37
UBE2C-204ENST00000356455 CFAP100Q494V2 611 aa23.58■■□□□ 1.37
UBE2C-204ENST00000356455 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
UBE2C-204ENST00000356455 CERS5Q8N5B7 392 aa23.58■■□□□ 1.37
UBE2C-204ENST00000356455 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.58■■□□□ 1.37
UBE2C-204ENST00000356455 GJA5P36382 358 aa23.57■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 CHRNDQ07001 517 aa23.57■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.57■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 STK31Q9BXU1 1019 aa23.57■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 H7C1W4 665 aa23.56■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 APAF1O14727 1248 aa23.56■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.55■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 SPDYE6P0CI01 402 aa23.55■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 ARHGEF6Q15052 776 aa23.55■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 PTPN18Q99952 460 aa23.55■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 ELP3Q9H9T3 547 aa23.55■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.54■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.54■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 NBPF11Q86T75 865 aa23.54■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 TSPYL6Q8N831 410 aa23.54■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 ZNF333Q96JL9 665 aa23.54■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 SNAP23O00161 211 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 TAF5LO75529 589 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 RASA3Q14644 834 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 OPTNQ96CV9 577 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 JAG2Q9Y219 1238 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 CENPFP49454 3210 aa23.53■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.52■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 CAP1Q01518 475 aa23.52■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 LAMB1P07942 1786 aa23.52■■□□□ 1.36
UBE2C-204ENST00000356455 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 MYCP01106 439 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 GCKRQ14397 625 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 AOX1Q06278 1338 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 CSF1RP07333 972 aa23.5■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
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UBE2C-204ENST00000356455 IL1R1P14778 569 aa23.49■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 TNFAIP1Q13829 316 aa23.49■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
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UBE2C-204ENST00000356455 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.49■■□□□ 1.35
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UBE2C-204ENST00000356455 CCL15Q16663 113 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 SLC4A2P04920 1241 aa23.47■■□□□ 1.35
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UBE2C-204ENST00000356455 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
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UBE2C-204ENST00000356455 H0YGN5 161 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 GTF2A2P52657 109 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 CASP7P55210 303 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2C-204ENST00000356455 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
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UBE2C-204ENST00000356455 PLIN1O60240 522 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 KIF22Q14807 665 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.44■■□□□ 1.34
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UBE2C-204ENST00000356455 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 CSADQ9Y600 493 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 MAP3K9P80192 1104 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 VGLL4Q14135 290 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 OTUD5Q96G74 571 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 FLIIQ13045 1269 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 LINS1Q8NG48 757 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2C-204ENST00000356455 TNNI2P48788 182 aa23.41■■□□□ 1.34
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