RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 ZIC5Q96T25 663 aa25.37■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 VPS37DQ86XT2 251 aa25.36■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.36■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.36■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 F8W031 263 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.35■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 CERS5Q8N5B7 392 aa25.35■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.35■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.35■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 METTL24Q5JXM2 366 aa25.34■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.34■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.34■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 USP44Q9H0E7 712 aa25.34■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 CFAP100Q494V2 611 aa25.33■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.33■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TTC9B-201ENST00000311308 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.33■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.32■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 GYG1P46976 350 aa25.32■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.32■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.32■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 JAG2Q9Y219 1238 aa25.32■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.32■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.31■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 ABHD8Q96I13 439 aa25.31■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.31■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.3■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 SPDYE6P0CI01 402 aa25.3■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 MOB2Q70IA6 237 aa25.3■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 CSRNP1Q96S65 589 aa25.3■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 A0A1B0GUL6 1792 aa25.29■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 PDE8BO95263 885 aa25.29■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 LRRC24Q50LG9 513 aa25.29■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 TRPA1O75762 1119 aa25.28■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 VEZTQ9HBM0 779 aa25.28■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 RNF186Q9NXI6 227 aa25.28■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.27■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.27■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TTC9B-201ENST00000311308 CLRN2A0PK11 232 aa25.26■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 TNFAIP1Q13829 316 aa25.26■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 PRKG1Q13976 671 aa25.26■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.26■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.26■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.25■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.25■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 KIF16BQ96L93 1317 aa25.24■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 EYA2O00167 538 aa25.24■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.24■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 SREBF2Q12772 1141 aa25.23■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 SLC5A1P13866 664 aa25.22■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 DGKZQ13574 1117 aa25.22■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.22■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 FBXO3Q9UK99 471 aa25.22■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.21■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 LPIN2Q92539 896 aa25.21■■□□□ 1.63
TTC9B-201ENST00000311308 UNCXA6NJT0 531 aa25.2■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.2■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 CRKP46108 304 aa25.2■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 RASA3Q14644 834 aa25.2■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 MAP3K11Q16584 847 aa25.2■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.2■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.2■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.2■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 TNNI2P48788 182 aa25.19■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 BCAMP50895 628 aa25.19■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.19■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 MAST3O60307 1309 aa25.18■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 CIAO1O76071 339 aa25.18■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 FGFR2P21802 821 aa25.18■■□□□ 1.62
TTC9B-201ENST00000311308 TM4SF4P48230 202 aa25.18■■□□□ 1.62
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