RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 FKBP1BP68106 108 aa27.3■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 DACT2Q5SW24 774 aa27.3■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 ZNF804AQ7Z570 1209 aa27.3■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 USP44Q9H0E7 712 aa27.3■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 KIF16BQ96L93 1317 aa27.3■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa27.29■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 TTLL5Q6EMB2 1281 aa27.29■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 MOB2Q70IA6 237 aa27.28■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 ANKRD44Q8N8A2 993 aa27.28■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 MXD3Q9BW11 206 aa27.28■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 GTF2IP78347 998 aa27.27■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 NBPF9Q3BBW0 867 aa27.27■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 CD209Q9NNX6 404 aa27.27■■□□□ 1.96
NME4-201ENST00000219479 MROH5Q6ZUA9 1318 aa27.26■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa27.25■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 HDAC9Q9UKV0 1011 aa27.24■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 HDAC5Q9UQL6 1122 aa27.24■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 UBE2Q2LH0YL09 131 aa27.23■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 UBE4AQ14139 1066 aa27.23■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 METTL24Q5JXM2 366 aa27.23■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 IRS2Q9Y4H2 1338 aa27.22■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 WNT10BO00744 389 aa27.22■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 MMP14P50281 582 aa27.22■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 KIAA0825Q8IV33 1275 aa27.22■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 ARHGAP45Q92619 1136 aa27.22■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa27.22■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 SOX10P56693 466 aa27.21■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 A0A1B0GUL6 1792 aa27.2■■□□□ 1.95
NME4-201ENST00000219479 IL1R1P14778 569 aa27.2■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 LRRC24Q50LG9 513 aa27.2■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 KLHDC4Q8TBB5 520 aa27.2■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 SASH1O94885 1247 aa27.19■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 VPS37DQ86XT2 251 aa27.19■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 GYG1P46976 350 aa27.17■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 JAG2Q9Y219 1238 aa27.17■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 BCAR3O75815 825 aa27.16■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 ECM29Q5VYK3 1845 aa27.16■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 F8W031 263 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 PDE8BO95263 885 aa27.15■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 TBC1D8O95759 1140 aa27.15■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 NF2P35240 595 aa27.15■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 CAVIN4Q5BKX8 364 aa27.15■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 GNAI3P08754 354 aa27.14■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa27.14■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 MEIS3Q99687 375 aa27.14■■□□□ 1.94
NME4-201ENST00000219479 EYA2O00167 538 aa27.13■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 TRIM27P14373 513 aa27.13■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 TM4SF4P48230 202 aa27.13■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 DLGAP5Q15398 846 aa27.13■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 CERS5Q8N5B7 392 aa27.13■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 HPS5Q9UPZ3 1129 aa27.13■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.13■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 VGLL2Q8N8G2 317 aa27.12■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 SIL1Q9H173 461 aa27.12■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 PRKG1Q13976 671 aa27.11■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 MFSD14BQ5SR56 506 aa27.11■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.11■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa27.1■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 ARMC9Q7Z3E5 817 aa27.1■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 FAM205AQ6ZU69 1335 aa27.1■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 MYO1BO43795 1136 aa27.09■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP27.09■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 FBXO3Q9UK99 471 aa27.09■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 LAMB1P07942 1786 aa27.08■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 GPR25O00155 361 aa27.08■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 SLC5A1P13866 664 aa27.08■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 FBXO33Q7Z6M2 555 aa27.08■■□□□ 1.93
NME4-201ENST00000219479 CIAO1O76071 339 aa27.07■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 SREBF2Q12772 1141 aa27.07■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 CFAP100Q494V2 611 aa27.07■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 LDLRAD1Q5T700 205 aa27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10 ms